Кроме чеченской проблемы в России существовали и другие: неотложным вопросом внутренней политики было оформление российской государственности. Речь шла о конкретной форме государственности: президентской республике (сильный президент, формирующий правительство и имеющий право при определенных обстоятельствах распускать парламент и объявлять новые выборы) или смешанной, президентско-парламентской республике. В декабре 1992 г. VII Съезд народных депутатов принял решение вынести обсуждение этого вопроса на Всероссийский референдум (апрель 1993 г.). Но вопрос о форме государственной власти на референдуме так и не был решен. Сама проблема выбора должна была неизбежно привести к конфликту между Президентом и парламентом.
Открытое столкновение произошло в сентябре – октябре 1993 г. 21 сентября 1993 г. Президент подписал указ о поэтапной конституционной реформе, роспуске Съезда народных депутатов Российской Федерации и Верховного Совета и проведении в декабре выборов в новый орган государственной власти. Руководство Верховного Совета и большинство членов Конституционного суда признали действия Президента неконституционными. В ночь с 21 на 22 сентября вице-президент А. В. Руцкой начал формировать параллельное правительство. Б. Н. Ельцин предъявил народным депутатам ультиматум – покинуть Белый дом (здание Верховного Совета России) до 4 октября.
2 октября 1993 г. в Москве начались демонстрации, строительство баррикад. На следующий день к 18 часам здания мэрии и гостиницы «Мир» оказались в руках восставших, была предпринята попытка штурма телецентра «Останкино». Президент объявил в столице чрезвычайное положение и ввел в Москву войска. 4 октября в 9 часов начался артиллерийский обстрел Белого дома. К 17 часам операция закончилась. Руководители и организаторы обороны Белого дома (в том числе А. В. Руцкой и Р. И. Хасбулатов) были арестованы и отправлены в тюрьму Лефортово. По официальным данным, в результате столкновений погибли 145 человек. 7 октября состоялись похороны погибших.
1993 г., 30 ноября – Указ Президента Российской Федерации Б. Н. Ельцина «О Государственном гербе Российской Федерации». Возвращение двуглавого орла в качестве Государственного герба России.
1995 г., 17 декабря – выборы депутатов Государственной Думы. Победа левых сил – КПРФ и АПР.
Референдум по вопросу о Конституции совпал по времени с выборами в Федеральное Собрание. Предвыборная борьба показала изменившуюся расстановку политических сил. В октябре 1993 г. сторонники продолжения радикальных реформ объединились в блок «Выбор России» (лидер – E. Т. Гайдар); представители местной и центральной администрации, выступившие за обновление России, объединились в партию российского единства и согласия (ПРЕС, лидер – Шахрай); в феврале оформилась Аграрная партия, выступавшая в защиту интересов крестьянства, преимущественно – бывшего колхозного (лидер – М. И. Лапшин); в феврале была восстановлена Коммунистическая партия Российской Федерации (КПРФ, лидер – Зюганов); активную позицию на выборах заняли ЛДПР (лидер – Жириновский), НДР (лидеры – С. А. Попов, А. А. Собчак), «Яблоко» (лидеры – Г. А. Явлинский, Ю. Ю. Болдырев, В. П. Лукин), Демократическая партия России (лидер – Н. И. Травкин), «Женщины России» (лидер – А. В. Федулова) и т. д.
Голоса избирателей по выборам в Государственную Думу распределились следующим образом: из 225 мест ЛДПР получила 59, «Выбор России» – 40, КПРФ – 32, Аграрная партия – 21, «Женщины России» – 21, «Яблоко» – 20, ПРЕС – 18, ЛДПР – 14.
Создание Федерального Собрания и принятие Конституции способствовали стабилизации общества и 28 апреля 1994 г. по инициативе Президента большинство (но не все) политических партий и общественных организаций подписали Договор об общественном согласии. 17 декабря 1995 г. состоялись выборы в VI Государственную Думу. Из 43 партий и блоков реально в борьбе участвовали 4 (КПРФ, ЛДПР, «Наш дом – Россия», «Яблоко»). В результате большинство мест в Думе – 149 – получила КПРФ.
В июне – июле 1996 г. состоялись выборы Президента России. 16 июня из 10 претендентов не набрал абсолютного большинства никто. Во втором туре – 3 июля 1996 г. – с преимуществом в 13 % голосов победу одержал Б. Н. Ельцин. Лидер КПРФ Г. А. Зюганов набрал 40 % голосов.
1996 г., ноябрь – декабрь – вывод федеральных войск из Чечни.
1997 г., март – назначение А. Б. Чубайса и Б. Е. Немцова («молодых реформаторов») первыми заместителями Председателя Правительства Российской Федерации. Проведение политики социально-экономической стабилизации.
1998 г., январь – начало деноминации российского рубля.