Однако в конце 2005 – начале 2006 г. вновь резко возросло число инцидентов между грузинской и осетинской сторонами с применением оружия. Ситуация обострилась в связи с общим кризисом в отношениях между Россией и Грузией и прекращением российской стороной выдачи виз грузинским гражданам. В Тбилиси остро восприняли неоднократные заявления Президента Путина о недопустимости двойных стандартов: предоставление полной независимости Косово при поддержке западных стран будет означать возможность признания самопровозглашенных республик на территории бывшего СССР, в том числе Южной Осетии. В итоге Южная Осетия опять превратилась в «осажденную крепость».
На этом фоне 12 ноября 2006 г. там состоялись президентские выборы и референдум по определению статуса республики. Результаты голосования подтвердили курс на самоопределение. Переизбранный президентом Э. Кокойты, не имевший реальных соперников, обратился в Конституционный суд РФ с просьбой признать Южную Осетию частью России. Аргументами послужило ее включение в состав Российской Империи еще в 1774 г. (т. е. раньше Грузии, включенной в Империю в 1801 г.) и отсутствие международно-правовых документов, закрепляющих ее выход из Российского государства; кроме того, 95 % жителей Южной Осетии являются гражданами России. Итоги голосования не были признаны ни Грузией, ни международным сообществом. Более того, Грузия изменила тактику: от непризнания существования Южной Осетии вообще она перешла к организации параллельного голосования в грузинских селах и среди беженцев, живущих в других регионах. Как и следовало ожидать, почти все участники этого голосования высказались за то, чтобы Южная Осетия осталась в составе Грузии. Таким путем Грузия создала своё «законное» правительство Южной Осетии.
6.2.8. Абхазия
После провозглашения независимости Грузии тбилисское руководство во главе с президентом Гамсахурдиа взяло курс на строительство унитарного государства. В ответ на возвращение к грузинской конституции 1921 г. абхазская сторона объявила о восстановлении своей Конституции 1925 г., объявлявшей Абхазию республикой в составе СССР и не предусматривавшей ее автономии в составе Грузии. В Абхазии был разработан проект договора с Грузией, нацеленный на создание федеративного государства. Однако 14 августа 1992 г. под предлогом защиты железной дороги грузинские войска и добровольцы вошли в Абхазию и заняли ее столицу – Сухум (по-грузински – Сухуми). Началась война, в которой на стороне Абхазии в составе добровольческих сил участвовали кабардинцы, адыгейцы, черкесы, абазины, чеченцы, армяне, русские казаки. В сентябре 1993 г. очень кровопролитные военные действия, сопровождавшиеся тяжкими насилиями над мирным населением (грузин – над абхазами, абхазов над грузинами), закончились взятием Сухума абхазами и победой Абхазии.
Позиция России в грузино-абхазском конфликте была двусмысленной и противоречивой. С одной стороны, официально Россия признавала территориальную целостность Грузии. Россия выступала посредником в переговорах между сторонами, выдвигала миротворческие инициативы. В 1994 г. в пограничье между Абхазией и Грузией по просьбе обеих сторон был введен российский миротворческий контингент, который сыграл значительную роль в предотвращении вооруженного противостояния и вскоре получил мандат СНГ. Россия пыталась неоднократно оказывать давление на Сухум, требуя от него уступок в переговорном процессе, вводила блокадные санкции.
В то же время несомненно, что дислокация на территории Абхазии российской военной базы в Гудаутах, батальона ВДВ в Сухуми и другие военные объекты сыграли значительную роль в ходе конфликта. Грузинская сторона и зарубежные эксперты, отмечая участие в боях тяжелой техники (по версии абхазов, «трофейной») и самолетов «без опознавательных знаков», считают, что победа абхазов была бы невозможна без прямой поддержки российских вооруженных сил. Позже Россия выдала примерно 70 % жителей Абхазии свои паспорта, восстановила железнодорожное сообщение с Сухумом. В Абхазии обращается российский рубль, выплачиваются российские пенсии. Без экономических связей с Россией (торговля, прием отдыхающих, переводы мигрантов) Абхазия вряд ли смогла бы выжить. В 2004 г. Москва попыталась воздействовать на исход президентских выборов в Абхазии, оказывая неприкрытый нажим на избирателей. Однако исход выборов оказался не в пользу поддерживаемого ей кандидата, хотя и был им оспорен. В Абхазии разразился многомесячный острый политический кризис, который пришлось урегулировать России. В итоге президентом был провозглашен представитель оппозиции С. Багапш, назначивший своего бывшего соперника Р. Хаджимбу премьер-министром. Все это вызывает резкие протесты Грузии.