Законом было запрещено создание партий по признакам профессиональной, расовой, национальной, религиозной принадлежности, а также образование структурных подразделений партий в органах государственной власти и органах местного самоуправления, в Вооруженных силах, правоохранительных и иных государственных органах. В декабре 2004 г. Государственная Дума по инициативе «Единой России» приняла поправки к закону о партиях, которые сделали требования к партиям значительно более жесткими. Минимальная численность их членов была увеличена до 50 тысяч, минимальная численность региональных отделений не менее чем в половине регионов – до 500 членов, минимальная численность остальных региональных отделений определена в 250 членов. В течение всего одного года партии должны были привести свою численность в соответствие с новыми требованиями, т. е. увеличить ее сразу в несколько раз. Согласно новому закону, в 2006 г. незадолго до того созданная Федеральная регистрационная служба (ФРС) должна была проверить число членов каждой партии. Одновременно была ужесточена финансовая и иная отчетность, которую партии должны представлять в ФРС. В случае невыполнения требований нового закона, после 1 января 2007 г. партии должны были быть распущены в судебном порядке или преобразованы в иные общественные объединения. В течение 2006 г. число официально зарегистрированных партий сократилось с 46 до 37. К сентябрю того же года была подтверждена нормативная численность 19 партий.
Процессуальные вопросы проверок ФРС оставались законодательно не регламентированными до 2006 г. В конце 2006 г. по этому вопросу был принят административный регламент. Хотя этот регламент – не закон, но в отечественной доктрине к «законодательству» часто относят и подзаконные акты. На практике проверки часто проводились даже без уведомления руководства партий, представляли собой поквартирные обходы их членов с участием милиции, фактически применявшей при этом те же методы, что и при проверке правонарушителей. Лидеры небольших партий заявляли о фактах административного давления на активистов, бюрократических придирках и т. п. Для создания новых партий были поставлены труднопреодолимые препятствия.
Действительно, как свидетельствует зарубежный опыт, деятельность региональных партий, фактически сформированных по этническому или конфессиональному принципу, может поставить под угрозу целостность государства. Большая часть партий, зарегистрированных в России, мало участвовала в политической жизни. Так, на выборах депутатов законодательных собраний, проходивших в 2006 г. в 18 субъектах, было представлено 28 партий, но только самые крупные из них («Единая Россия», КПРФ, Российская партия пенсионеров, ЛДПР, Российская партия Жизни, «Патриоты России») заявили свои списки или кандидатов более чем в 13 регионах. Только 14 партий получили хотя бы один мандат и только 6 – более 10 мандатов.
Действенным инструментом неформального контроля Кремля над партиями стало их финансирование из так называемой «черной кассы» Администрации Президента, о чем неоднократно сообщала оппозиционная пресса.
Одновременно с ужесточением закона о партиях в годы первого президентства Владимира Путина не прекращался пересмотр избирательного законодательства в зависимости от потребностей «партии власти». Государственная Дума приняла шесть законов, корректирующих рамочный закон «Об основных гарантиях избирательных прав граждан Российской Федерации», и семь законодательных актов по изменению закона о выборах Государственной Думы. Эти изменения носили радикальный характер, были осуществлены вопреки мнению оппозиции и направлены на укрепление и стабилизацию партийной системы с доминирующей ролью одной-двух правительственных партий. В частности, закон, принятый в мае 2005 г., предусматривает переход от смешанной к пропорциональной избирательной системе (т. е. по партийным спискам). Еще раньше было установлено, что к распределению мандатов в Государственной Думе будут допущены только партии, получившие не менее 7 % действительных голосов, а не 5 %, как ранее. Только по пропорциональной системе отныне избирались законодательные собрания ряда субъектов Федерации.