Сдача Москвы приводит Россию в шок. Она укрепляет сильных, но деморализует слабых. Положение Александра очень сложно. В его окружении раздаются многочисленные голоса сторонников заключения мира с Наполеоном. Среди наиболее настойчивых — Аракчеев и цесаревич Константин. Царь чувствует, что его окружает глухая враждебность. Его считают виновным за обрушившиеся на страну несчастья. Однако заслугой Александра является его непоколебимость. «Наполеон или я, он или я, двоим нам нет места», — говорит он. 24-го Наполеон посылает к нему эмиссара с предложениями начать мирные переговоры. Предложение остается без ответа. 4 октября Лористон, везущий письмо императора, появляется перед русскими аванпостами. «Но, увы, это была лишь несбыточная мечта, так как Кутузов сам послал полковника Мишо к императору Александру, умоляя от имени всей армии не заключать мира. Монарх не только самым решительным образом заверил его в этом, но даже сделал фельдмаршалу выговор за то, что тот приложил руку к этим авансам» (Жомини).
Однако русская армия продолжает отступление. Неожиданно Кутузов поворачивает на запад, огибает Москву с юга и выходит на старую Калужскую дорогу. Он хочет зайти во фланг Великой армии и угрожать ее коммуникациям, одновременно прикрывая Тулу, где находятся оружейные заводы и крупные запасы вооружения. Кроме того, он хочет укрепить армию перед дальнейшими боями. Этот маневр осуществлен очень ловко. Пока Ефремов дурачит Себастиани, уводя его за собой по Рязанской дороге, главные силы русских идут на Красную Пахру. Французы теряют русскую армию, и до 26 сентября у Наполеона не будет о ней никаких сведений. «Данный маневр — одна из самых удачных операций в этой войне» (Жомини). Из Красной Пахры Кутузов направляется в Тарутино, где пробудет с 4 по 18 октября. «Теперь ни шагу назад», — говорит он. Масштабы сделанного фельдмаршалом за эти две недели поражают. В армию поступают подкрепления, оружие, лошади; умножаются арсеналы и склады, идет активное обучение новобранцев, поднимается боевой дух. «Каждый день, проведенный в Тарутино, был золотым днем, и мы хорошо ими распорядились», — скажет Кутузов. Численность армии доведена до 120 тыс. человек. Одновременно Кутузов начинает беспощадную партизанскую войну в тылах Великой армии. Сформированы многочисленные отряды из казаков и легкой кавалерии, которые направляются на линии коммуникаций противника с целями укреплять население в решимости бороться с врагом, координировать действия народных отрядов, нападать на обозы, перехватывать курьеров, вредить неприятелю всеми возможными способами. Результаты малой войны весьма впечатляют. За время своего пребывания в Москве от действий партизан Великая армия потеряла 30 тыс. человек. «Люди и лошади возвращались измученными, если вообще возвращались, каждую меру овса, каждую охапку сена приходилось отнимать у противника с боем. Постоянно случались бои, нападения из-за угла. Мы постоянно несли потери. В войну вмешались крестьяне. Так что война была повсюду, на флангах, в тылу» (Сегюр).
Со времени сдачи Москвы Александр продолжает слать Кутузову инструкции. Пока основные силы будет сдерживать Великую армию, оставшиеся войска, находящиеся на флангах, соединятся и на Березине перекроют Наполеону все пути отступления. Когда боевые действия возобновляются, соотношение сил изменилось в пользу русских. Корпус Штенгеля, высадившийся в Риге, усиливает занимающий позиции между Ригой и Полоцком русский правый фланг, численность которого достигает теперь 60 тыс. человек. После соединения армий Тормасова и Чичагова численность наших войск на левом фланге достигает 80 тыс. человек. Вместе со 120 тыс. войск Кутузова общая численность русских армий составляет 260 тыс. человек, к которым следует прибавить силы ополчения (200 тыс.). Это вдвое больше, чем осталось у Наполеона.