ЦК РКП (б) повседневно руководил частями особого назначения. Письма ЦК ярко свидетельствуют о том, как много внимания уделяла партия коммунистическим отрядам. 12 августа 1921, ЦК РКП (б) писал в специальном циркуляре: "Борьба с контрреволюцией, требующая от нас большого внимания и военного напряжения, продолжается. На окраинах развивается бандитизм; только что подавлено затянувшееся восстание в Тамбовской губернии, не ликвидирован еще окончательно так называемый "Союз трудовых крестьян" (Сибирь). Голод, охвативший огромную территорию страны в 1921 году, создал благоприятную почву для усиления контрреволюции. Зарубежные контрреволюционеры делают все, чтобы использовать голод для организации крестьянских и рабочих выступлений. Вместе с тем мы вынуждены провести значительное сокращение армии. Все это выдвигает перед нашей партией задачу особой партийной и государственной важности — задачу неотложно и энергично поднять боевую мощь частей особого назначения".
Спустя год после опубликования этого циркуляра секретарь ЦК РКП (б) В. В. Куйбышев писал всем губкомам и обкомам партии: "Годовой опыт частей особого назначения (ЧОН) показал правильность линии партии в деле создания вооруженной силы авангарда рабочего класса. ЦК полагает, что устойчивость международного положения Республики, прочность Советской страны не могут заставить партию отказаться от военно-боевой подготовки своих сил".
В борьбе с бандитизмом местные ЧК и части особого назначения (ЧОН) действовали рука об руку, как два вооруженных отряда Коммунистической партии.
В трудных условиях проходила борьба с бандитизмом в Белоруссии и на Украине. На Украине бесчинствовали банды Махно (на Левобережье) и Петлюры (на Правобережье). И тот и другой получали поддержку от правительств Польши и Румынии.
Выполняя директивы англо-франко-американских империалистов, белопанская Польша сделала свою территорию плацдармом, откуда производились бандитские налеты на Советскую страну.
Польское правительство заключило негласный договор с главарем украинских буржуазных националистов атаманом Петлюрой о формировании бандитских отрядов и переброске их на Украину. Савинков и Петлюра создали в западных районах Советской республики густую шпионскую сеть, которая снабжала их шпионскими донесениями, вербовала бандитов, дезорганизовывала работу советских учреждений.
После разгрома Деникина и Врангеля остатки армий этих генералов бежали за границу. В Турции, Болгарии, Румынии, Польше, Югославии, Чехословакии скопились десятки тысяч белогвардейцев. Империалистические государства формировали из белоэмигрантов бандитские отряды, вооружали их и перебрасывали на советскую территорию. Здесь к бандитам присоединялись буржуазные националисты, кулаки, анархистские элементы из мелкой буржуазии города и деревни. Бандиты терроризовали население, убивали советских работников, разрушали промышленные объекты.
К июлю 1921 г. только в шести уездах Белоруссии насчитывалось до 40 банд численностью около полутора тысяч человек. В Польше для них было подготовлено "пополнение" — ещё около 4 тысяч человек.
Наряду с Польшей бандитские группы формировались и засылались в нашу страну и из Румынии. В течение 1921 г. на советскую территорию было переброшено из Польши 15 крупных банд, а из Румынии — три. Численность банд доходила до 3 тысяч человек.
Борьба с политическим бандитизмом представляла собой одну из главных задач ВЧК в первый период после окончания гражданской войны.
В январе 1921 г. по решению президиума ВЧК все местные чрезвычайные комиссии на Правобережье Украины были объединены под руководством специально уполномоченного ВЧК, командированного из Москвы.
Для осуществления общего руководства борьбой с бандитизмом на Украине было создано "Военное совещание" во главе с командующим войсками Украины и Крыма М. В. Фрунзе. В Донецкой губернии в феврале 1921 г. была сформирована Донецкая дивизия ВЧК, сыгравшая крупную роль в ликвидации бандитизма на Украине и, в частности, в разгроме банд атамана Махно, орудовавших в Полтавской и Екатеринославской губерниях. Особенно отличилась при этом Богучарская бригада. С 25 мая 1921 г. бригада принимала непосредственное участие в боевых действиях против бандитов. Ею были разгромлены банды Каменюка, Блохи, Белокобыльского, Сычова и других. Бандиты потеряли только убитыми 1250 человек. За боевые заслуги Богучарская бригада была награждена Почетным революционным знаменем.
В дальнейшем 28–30 июня 1921, Донецкая дивизия войск ВЧК, в состав которой входила Богучарская бригада, наголову разгромила в районе села Недрыгайлова повстанческую армию Махно.