С началом гражданской войны в Трапезундской империи генуэзцы оказались так или иначе вовлеченными в нее. 4 сентября 1342 г. феодальная группировка Схолариев — Доранитов при помощи трех генуэзских судов произвела государственный переворот[2408]
. С воцарением Иоанна III (1342–1344) влияние генуэзцев в Трапезунде возросло: они смогли, совершив демарш перед императором, воспрепятствовать в 1344 и 1345 гг. строительству венецианских укреплений, что вызвало протест Республики св. Марка[2409]. Разразившийся затем вооруженный конфликт Генуи и Великих Комнинов следует целиком отнести к 1348–1349 гг. В январе 1348 г., писал Панарет, генуэзцы внезапно взяли и сожгли Керасунт[2410]. 5 мая следующего года 2 франкские катерги прибыли из Каффы. Выступившие против них большой и малый катергоны вместе с несколькими барками трапезундцев были разгромлены генуэзцами. Командующий — великий дука Иоанн Кавасит, Михаил Чанихит и многие другие погибли[2411]. В ответ на действия генуэзцев «франки» на суше были ограблены и брошены в тюрьму, генуэзские суда отошли[2412]. Последнего эпизода касается и сообщение Григоры. Византийский писатель соединил рассказ о генуэзско-татарском столкновении в Тане и о событиях в Трапезунде. В сентябре 1343 г. в Тане венецианцем Андриоло Чиврано был убит оскорбивший его татарин, подданный хана Джанибека (1342–1357). Вспыхнула ссора, началась резня. Дело кончилось тем, что все латиняне были изгнаны ханом из Таны, а их имущество было разраблено. Конфликт продолжался почти 5 лет[2413]. Рассказывая об этом выступлении латинян против «скифов», Григора полагал, что из страха перед подобными же действиями трапезундцы, окружив латинян, многих из них перебили, а оставшиеся в живых смирились[2414]. Еще В. Гейд показал, что происшествия в Тане и Трапезунде не связаны между собой[2415], однако ни он, ни другие исследователи не пересмотрели дату событий в Трапезунде — 1343 г.[2416] Однако конфликта между генуэзцами и Трапезундом между 1343 и 1348 гг. не было. Накануне 1344 г. генуэзское посольство сумело устранить с императором накапливавшиеся противоречия[2417]. Генуэзская фактория на Понте вела активную жизнь, туда прибывали лигурийские суда[2418], и велась торговля с купеческими караванами из Персии[2419], а генуэзский вице-консул добился-таки поддержки императора в споре с венецианцами по поводу строительства укреплений венецианского участка в 1344–1345 г.[2420] Ничто не говорит о прерванных или нарушенных связях.