Для народов Центрально-Восточной Европы, которые все к этому времени были порабощены нацистами, эта совместная декларация была призывом, аналогичным программе построения мира Вильсона после Первой мировой войны. Менее конкретная, чем Четырнадцать пунктов, Атлантическая хартия, однако, включала торжественное обещание, что «суверенные права и самоуправление» будут «возвращены тем, кто был насильно их лишен». В полном согласии с этим обещанием правительства в изгнании тех союзных государств, которые Германия лишила суверенных прав и самоуправления, были приняты в Вашингтоне для подписания 1 января 1942 г. Деклараций Объединенных Наций, которые подтверждали принципы Атлантической хартии. Правительства в изгнании союзных государств Центрально-Восточной Европы в это время делали свой конструктивный вклад в общую программу построения мира путем подготовки федеративной системы. Она была основана на плане конфедерации, объявленном уже 11 ноября 1940 г. правительствами Польши и Чехословакии (последнее было реорганизовано в Лондоне, и Эдвард Бенеш снова занял пост президента), и на аналогичном греко-югославском договоре от 15 января 1942 г. Тесное сотрудничество обеих групп в федеральной системе, открытой и для других государств Центрально-Восточной Европы, было включено в тот проект послевоенной Организации Объединенных Наций.
Советское правительство тоже подписало Декларацию Объединенных Наций и тем самым косвенно примкнуло к Атлантической хартии, включая ее первую статью, в которой подписавшиеся стороны обещали «не стремиться к расширению, территориальному или иному». Но, согласно советскому толкованию, это обязательство не относилось к такому «расширению», которое Советский Союз уже получил до составления Атлантической хартии в годы сотрудничества с нацистской Германией. Притязания на Восточную Польшу, три Прибалтийские республики и части Финляндии и Румынии поэтому оставались. Более того, советское правительство было явно против любой федерации или конфедерации западных соседей Советского Союза и практически заставило правительство Чехословакии прекратить свои переговоры с правительством Польши по этому вопросу. Более чем правительства Греции и Югославии в изгнании, правительство Польши считалось недостаточно «дружеским» по отношению к России, потому что оно не было готово уступить ее территориальным притязаниям.
Но так как Великобритания и особенно Соединенные Штаты тоже все еще колебались в признании этих притязаний, нужно было найти другой предлог для официального разрыва отношений с этим правительством. Этот первый удар России по единству союзников, нанесенный 25 апреля 1945 г., был мотивирован тем, что польское правительство потребовало провести расследование Международного Красного Креста убийства тысяч польских офицеров, взятых в плен русскими в 1939 г., исчезновение которых советское правительство не могло объяснить на протяжении уже почти двух лет и тела которых были обнаружены в массовом захоронении в лесу под Смоленском. СССР счел само требование беспристрастного расследования «вероломным ударом Советскому Союзу», давлением, оказываемым «на пару с Гитлером», с целью «вырвать территориальные уступки» у советских республик.
После разрыва отношений с законным правительством Польши, которое 6 июля того же 1943 г. лишилось в авиакатастрофе премьер-министра и главнокомандующего генерала Сикорского, Советская Россия открыто противопоставила этому правительству небольшую группу польских коммунистов, которые продолжали работать в Москве как Союз польских патриотов. Был установлен контакт с некоторыми коммунистами на оккупированной территории Польши, чтобы разделить в этой стране, как и в Югославии, движение Сопротивления. В случае Польши было особенно очевидно, что, когда Красная армия в своем победоносном наступлении после Сталинграда достигнет территории этого союзного государства, освободители вместо восстановления суверенитета и самоуправления просто сменят оккупацию с немецкой на русскую, сделают невозможным возвращение национального правительства и навяжут населению власть коммунистов.