Жители Константинополя прекрасно это осознавали. Они смеялись над неотесанностью Михаила II, но и боялись его. И все-таки он оказался лучшим правителем, чем они ожидали, и его правление отмечено не грубостью и жестокостью, а крепким здравым смыслом. Руководствуясь именно им, он короновал своего семнадцатилетнего сына Феофила, сделав его соправителем. Михаил II прекрасно осознавал, что стал седьмым по счету василевсом за последние четверть века и что двое из его предшественников были низложены, двое погибли в битвах, а еще двоих убили. Кроме того, последние три из них не приходились друг другу и ему самому родственниками. Больше всего империя нуждалась в стабильности, и коронация Феофила стала первым шагом в этом направлении. Однако Феофилу самому следовало обзавестись наследником, так что вторым шагом была его женитьба на Феодоре, девушке поразительной красоты из Пафлагонии.
К тому времени империя вновь оказалась под угрозой – на сей раз со стороны военного авантюриста Фомы Славянина. Пока был жив Лев, поручивший ему командование значительными военными силами, Фома не доставлял никакого беспокойства, но, как только трон перешел к его давнему сопернику Михаилу, он принялся подстрекать народ к мятежу. На Востоке Фома объявил себя императором Константином VI, которому чудесным образом удалось избежать ослепления по приказу своей матери Ирины, и даже организовал церемонию коронации в Антиохии, которая тогда находилась в руках мусульман. На Западе Фома занял позицию ярого противника иконоборчества, надеясь таким образом завоевать широкую поддержку. Он повсюду выставлял себя борцом за права бедняков и всех, кто находился под гнетом налогов и коррумпированных чиновников. Несмотря на довольно почтенный возраст, в нем, похоже, было что-то привлекательное: его любезность и обаяние резко выделялись на фоне несвязной и грубой речи императора. Однако бесчисленные сторонники Фомы не знали, что он получал значительную финансовую поддержку от халифа аль-Мамуна, которому он вполне мог пообещать в случае успеха сделать империю феодальным владением халифата.
Этот испорченный, обидчивый и все же харизматичный человек вторгся в империю весной 821 года, и в течение нескольких месяцев всего две фемы во всей Малой Азии остались верными Михаилу II. Поняв, что у него за спиной находится практически вся империя от Арарата до Эгейского моря, в декабре 821 года Фома прошел через Фракию и осадил Константинополь. Однако жители столицы отличались от жителей Анатолии. Они сопротивлялись со своим обычным мужеством, а стены их города, как всегда, были прочными. Осадные машины Фомы не могли сравниться с катапультами и баллистами, которые Михаил II приказал разместить на крепостных валах; и, хотя он разгромил флот у анатолийского побережья, яростные зимние ветра не давали его кораблям причинить городу какой-то значительный ущерб. Когда настала вторая после мятежа зима, Фома все еще не сумел одержать ни одной крупной победы, но эта патовая ситуация могла бы длиться бесконечно, если бы не сын Крума Омуртаг, который заключил с империей тридцатилетнее перемирие и предложил Михаилу помощь оружием. В марте 823 года огромное войско болгар помчалось на юг и наголову разбило мятежную армию на равнине близ Гераклеи. Когда несколько недель спустя император выехал из столицы со своей армией, чтобы раз и навсегда разобраться с Фомой, у того уже не было сил к сопротивлению. Фома попытался применить обычную тактику притворного бегства, но, когда следовало повернуться и напасть на врага, его войска просто сложили оружие. Сумев уйти с горсткой соратников, он бежал в Аркадиополь и забаррикадировался там.
Роли поменялись: Михаил II стал осаждающим, а Фома осажденным. Фома продержался все лето, но в октябре, когда его люди были вынуждены поедать гниющие трупы лошадей, стало ясно, что дальнейшее сопротивление невозможно. Император послал в город сообщение, в котором обещал солдатам полное помилование, если они передадут своего предводителя в его руки. Не желая подвергнуться массовому истреблению, те согласились. Фому привели к императору в цепях и грубо толкнули на землю; Михаил II поставил на шею жертвы ногу в багряном сапоге и объявил его участь: ему надлежало отрубить ступни и кисти, а тело посадить на кол. Приговор немедленно привели в исполнение, и к началу 824 года самое серьезное восстание в византийской истории завершилось.