Однако Декебал не считал себя окончательно разбитым и готовил новые столкновения с римлянами, начавшиеся в 105 г.н.э. Из Рима поступило подкрепление, и таким образом, на Нижнем Дунае теперь стояло не менее 14 легионов и сильные вспомогательные формирования, то есть почти половина всех римских войск. Декебал хотел внезапным нападением вырвать инициативу, вытеснить римлян с юго-запада Трансильвании и блокировать перевал Железных Ворот. С переменным успехом сражения Дакской войны, которую он развязал, длились до осени 106 г.н.э. Подробности этой войны до конца не выяснены, потому что отраженные в источниках эпизоды и изображенные на колонне Траяна сцены, «высеченная в камне книга с картинками о Дакской войне» (Т.Моммзен) представляют неполное и недостоверное отражение событий.
Однако точно известно, что эти битвы велись с крайней жестокостью и ожесточением с обеих сторон. Отчаянное сопротивление даков в их горных укреплениях и в сожженой ими самими столице Сармизегетузе привело к жестокой резне и переселению больших групп населения. Один попавший в плен римский военачальник выбрал добровольную смерть, так же поступали и многочисленные дакские аристократы и, в конце концов, сам Декебал, отрубленная голова которого была отослана в Рим и по жестоким обычаям принципата брошена в грязь на Гемонской лестнице. На найденной в 1965 г. у Филипп надгробном стеле некий Тиберий Клавдий, наоборот, хвалится тем, что он якобы захватил Декебала и его отрубленную голому передал Траяну в Ронистре, находящемся во внутренней части Трансильвании.
Когда к концу 106 г.н.э. было подавлено последнее дакское сопротивление в Карпатах, сразу же началось создание провинциальной администрации под началом первого наместника Д.Теренция Скавриана. В его проконсульскую провинцию были включены Банат, большая часть Трансильвании и северо-запад Олтеницы; часть Валахии и другие занятые римлянами районы сначала управлялись из провинции Мезия. Одновременно большая провинция Паннония была разделена на две новые, одна из которых Верхняя Паннония, предприняла наступления на Среднем Дунае на маркоманнов и квадов. Провинция Нижняя Паннония, первым наместником которой являлся будущий принцепс Адриан, была сориентирована на восток с целью осуществления контроля над сарматскими язигами.
Через еще не завоеванные области на юго-западе Дакии вдоль берегов Тисы, где жили язиги, Траян начал строить соединительные дороги. Римские форпосты были одновременно продвинуты севернее дельты Дуная. Таким образом, Молдавия и Бессарабия превратились в своего рода римский гласис. Как мощный бастион, лежала теперь Дакия перед римским дунайским фронтом. С мезийских и паннонийских провинций этим было снято опасное внешнее давление, и от дакского укрепления теперь было можно в любое время продвигаться на большие равнины на западе, востоке и севере.
Так как область Воеводино и Большая Валахия были включены в новую провинцию Дакия, римская граница на Нижнем Дунае значительно удлинилась. Из-за большой разницы высот в Карпатах нечего было и думать о границе, замкнутой вокруг Дакии. Поэтому валами и крепостями укрепили особо опасные отрезки границы, прежде всего в Банате, на крайнем севере в районе Апула и Потаиссы, на востоке вдоль реки Олт, где плотно выстроенная Алутанская граница препятствовала прерыванию римских коммуникаций с Трансильванией.
Оккупация Дакии уже через десять лет ограничилась одним легионом, стоящим гарнизоном в Апуле, и только при Марке Аврелии туда был введен еще один в Потаиссу. Охрану границы осуществляли 12 вспомогательных групп. Это относительно небольшое военное присутствие свидетельствует о том, что после большого кровопускания Второй Дакской войны Рим больше не опасался серьезной угрозы своему господству в этом регионе.
Таким образом, Траян, остававшийся на Нижнем Дунае до начала лета 107 г.н.э., полностью разрешил дакский вопрос. Материальные ожидания не разочаровали римлян. По данным позднеантичного автора Иоанна Лида, который ссылается на лейб-медика Траяна Т.Статилия Кри-тона, в руки римлян попало около пяти миллионов римских фунтов золота, в два раза больше серебра и около 500 тысяч военнопленных. Добыча, как полагается, была щедро разделена между армией и римским народом, а в Риме устроены праздничные игры, которые затмили все, что видела до сих пор взыскательная столица. Только в жестоком финале этой 117-дневной оргии выступала 4 941 пара гладиаторов, а в Колизее для боев было собрано 11 000 диких зверей. Одновременно начала осуществляться грандиозная строительная программа, трудности римской валюты были ликвидированы, цена на золото упала на 3—4 %. Популярность Траяна достигла апогея.