В 1847 году Богоявленский монастырь сильно пострадал от пожара. В 1860-x годах обитель была возрождена, но уже как женская и получила название Богоявленско-Анастасииной. При советской власти монастырь был упразднен, возрождение его началось в 1990 году. Считается, что мощи преподобного Никиты и поныне покоятся под спудом в подклете монастырского собора. В Богоявленском кафедральном соборе хранится главная святыня царского дома Романовых – Феодоровская икона Божией Матери.
Недалеко от Костромы, в окрестностях города Галича, подвизался еще один ученик Радонежского старца –
После долгих лет иноческого послушания Преподобный Сергий благословил Иакова покинуть монастырь и стать пустынником. Иаков отправился в родные галичские леса и построил себе хижину близ селения Железный Борок, где жил в одиночестве и безмолвии. Однако вскоре уединение его было нарушено людьми, желавшими получить от монаха утешительное слово.
Пустынное братство разрасталось. В 1390 году Иаков получил от митрополита Киевского и всея Руси Киприана грамоту с благословением на строительство деревянного храма в честь Рождества святого Пророка, Предтечи и Крестителя Господня Иоанна. Так близ Железного Борка возник монастырь во имя Рождества Иоанна Предтечи.
После многих лет совместных подвигов иноки просили преподобного Иакова быть их игуменом. Он смиренно покорился их просьбе и поехал в Москву, где был облечен священным саном.
Железноборовскому монастырю покровительствовали московские князья. В 1415 году, когда супруга князя Василия I Дмитриевича София Витовтовна тяжело страдала в родах, преподобный Иаков предсказал ей благополучное разрешение от бремени и рождение наследника. Вскоре наследник, будущий великий князь Василий Васильевич, появился на свет, и Василий I в благодарность пожертвовал Железноборовской обители земли и средства на строительные работы в монастыре. В 1420 году в Галичской земле случился голод. Множество голодных и бедных людей, разоренных татарами, кормилось при обители.Во время набега татар на Костромскую землю в 1429 году Железноборовский монастырь был сожжен дотла, иноки укрылись в окружавшем монастырь бору. Позже они вернулись на то же место и построили новую обитель. Железноборовский монастырь не раз был сожжен во время татаро-монгольских и польско-литовских нашествий, но неизменно восстанавливался и отстраивался заново.