В Калужской Семинарии до 1799 г. было только два класса — высший и низший грамматические. Учитель первого получал 60
В июне 1800 г. Семинария была переведена из Лаврентьевского монастыря в город. Ей отвели каменный двухэтажный корпус, устроенный «по апробованному плану» для верхнего земского суда, уездного и нижнего земских судов, верхней и нижней расправы, дворянской опеки, губернского и городового магистрата. Это тот самый корпус, что Семинария занимает ныне. По упразднении средних судебных мест (1796 г.) нижний этаж в 1798 г. был переделан для поставки казенного вина и поклажи соли, не умещавшихся в магазинах. Корпус был передан и принят духовным ведомством в 1802 г. В 1806 г. были освобождены от казенного вина и соли подвалы. При Семинарии помещался архиерейский дом до 80-х гг. XIX в. В 1811 г. была устроена при архиерейском доме . Учащихся к этому времени в Семинарии было до 900 человек, так как и Семинария и училище помещались в одном здании. В 1800 г. уже были открыты риторический и философский классы, а в 1802 г. богословский. Преподавателей в 1809 г. в Семинарии было 9. В это же время в Семинарии было общежитие — бурса (при еп. Евлампии), но пансионеров в ней в 1809 г. было только 20 человек.
В 1812 г. в семинарском корпусе помещался военный лазарет. С 1810 же года началась подготовка к реформе 1814 г., когда училища были отделены от семинарий. Было постановлено открыть 3 духовных училища. Весною 1810 г. было открыто Боровское для четырех классов в корпусе, где помещалось в Боровске ранее духовное правление. В 1867 г. оно было переведено в Калугу. Другое училище было намечено в Мещовске, но дело затормозилось до 1815 г., когда, наконец, оно было основано. Намечалось было училище в Козельске или в Добром монастыре (Лихв. у.), но не было открыто. Духовное же калужское училище, несмотря на отделение от семинарии, пребывало в ее здании до 1840 г. Это здание приспособлялось к потребностям заведения и переделывалось почти в течение всего столетия, вплоть до 1896 г., когда оно, наконец, было приведено в надлежащий культурно-просветительному питомнику вид.
Из питомцев семинарии было 16 епископов, протопресвитер И. Л. Янышев, проф. И. А. Чистович (дух. акад.), Я. А. Чисстович (мед. — хир. акад.), проф. Н. И. Соколов (мед. — хир. акад.), проф. М. М. Троицкий (психолог) проф. А. И. Чупров (экономист), В. Т. Покровский, писатель Г. Недетовский (О. Забытый) и мн. др.
В 1911 г. в Семинарии было 439 учеников с бюджетом заведения в 70.814
Перед семинарией и присутственными местами кругом собора, разбит красивый сквер, среди которого особенно рельефно выделяется величественный