Наиболее явно отношение к Холокосту Православной Церкви на оккупированной территории Советского Союза проявилось на Украине, где проживала большая часть евреев СССР. Уже в первые недели оккупации тех или иных районов республики немцы приступили к массовому уничтожению еврейского населения и заключению оставшихся в живых в гетто. Всего на территории Украины было создано 442 гетто, больше, чем где бы то ни было. В г. Каменец-Подольском была проведена первая массовая акция уничтожения на территории СССР летом 1941 г. (около 24 тысяч человек, включая евреев, депортированных из Венгрии). Важным фактором, влиявшим на судьбу евреев, было сотрудничество с нацистами организаций украинских националистов, которые активно участвовали в уничтожении.
Символом уничтожения евреев Советского Союза стал Бабий Яр в Киеве. Это был самый массовый расстрел на территории СССР. Уже через 5—10 дней после оккупации Киева, 24–29 сентября 1941 г., зондеркомандой СС 4а, согласно ее отчету, в Бабьем Яру были расстреляны 33 771 еврей (помимо представителей других национальностей). Вплоть до 1943 г. в Бабьем Яру расстреливали скрывавшихся евреев Киева, а также жителей других украинских городов и беженцев. Всего там было убито около 50 тысяч (по другим сведениям, до 70 тысяч человек). Общее число уничтоженных евреев, бывших жителями Украины на 22 июня 1941 г., составляет свыше 1 миллиона 400 тысяч человек, то есть более половины советских евреев, погибших во время Великой Отечественной войны, и около четверти всех погибших евреев Европы. Таким образом, Украина потеряла более 60 % своего довоенного еврейского населения455
.С 1988 г. еврейские организации Украины ведут поиски людей, спасавших евреев. К середине 2001 г. Еврейский совет Украины и фонд «Памяти жертв фашизма» присвоили звание «Праведник Украины» более 4500 лицам, из которых 431 человек спасал евреев в Киеве. На 1 января 2012 г. институт Яд Вашем присвоил звание «Праведников народов мира» 2402 жителям республики. Из всех областей Украины по числу Праведников лидирует Винницкая область, население которой было в подавляющей части православным. Известно также, что несколько сот украинцев, казненных нацистами за различные «преступления», поплатились жизнью за помощь евреям или их укрывательство456
. Среди погибших таким образом людей были и православные священнослужители.В период оккупации республики на ее территории существовали две Украинские Православные Церкви — автономная в составе Московского Патриархата и автокефальная (самостоятельная). Автономная Украинская Церковь в целом однозначно не одобряла политики преследования евреев и антисемитской пропаганды (за редкими исключениями) не вела. Многие ее священнослужители пытались различными способами спасти гонимых за их национальную принадлежность людей.
В ряде случаев клирики и простые миряне открыто и подчас небезуспешно протестовали против уничтожения евреев. Так, в местечке Товта на Волыни подобная массовая казнь была остановлена священником Извольским. Ряд православных священников и члены их семей с риском для жизни прятали евреев. Скрывавшимся доставали поддельные документы; если это было невозможно — отдавали свои. Например, в женском Фролов-ском монастыре Киева настоятельница обители игумения Флавия укрывала еврейскую девочку Лиду Фельдман и других еврейских детей. В г. Симферополе православный священник также прятал в своем доме еврейских детей457
.Еврейская девочка Юлия Пензюр, которой 15 сентября 1943 г. исполнилось семь лет, накануне потеряла десять своих родственников в результате акции уничтожения в деревне Тирливке Бершадского района Винницкой области. После войны она с благодарностью говорила о тех, кто помог выжить ей с матерью, и среди этих спасителей вспоминала, не называя имени, священника, который хотел ее крестить, чтобы спасти458
.