Он вернулся на работу в Комитете, когда первая волна гриппа поразила Северную Францию, и последующая роль Флетчера состояла в контроле исследований, проводимых во Франции в больничных патологических лабораториях. Медицинские лаборатории в стране продемонстрировали «решающую роль британской военной медицины в формировании официальной стратегии борьбы с пандемией» [13]. В течение весны и осени 1918 года Военное министерство, Армейская медицинская служба и Комитет медицинских исследований, которые координировали действия британской медицины, совместно собирали официальные данные и создавали стратегии борьбы с эпидемиями. До эпидемии эти органы совместно работали над созданием системы военной патологии, которая связывала патологические лаборатории с базовыми и полевыми госпиталями во Франции и Фландрии. Эта система была организована для сбора, выделения и идентификации патогенов от больных, участвовавших в боях, а также для облегчения производства вакцин и сывороток крови, содержащих антитела против специфических антигенов и вводимых для лечения или защиты от определенных заболеваний. Специалисты военной патологии обеспечивали проведение терапевтических и профилактических мероприятий против целого ряда заболеваний на поле боя и верили, что таким же образом они смогут справиться с гриппом.
Объединению усилий армии и медицинских исследователей способствовал тот факт, что обе стороны имели много общих черт. Медицина была создана по военному принципу с точки зрения дисциплины, организации, ранга и униформы, с опорой на командную работу и специализацию [14]. По этой причине медицинские исследования удачно встроились в военную машину. Крупномасштабная связь объединяла пункты сбора раненых на фронте с полевыми и базовыми госпиталями, прикрепленными к каждой армейской дивизии. Полевые госпитали в Англии поддерживались «территориальными» больницами, которые были соединены с крупными лондонскими и провинциальными больницами при медицинских учебных заведениях. Ими управляли консультанты, которым давались временные звания в Королевском медицинском корпусе и выплачивалась зарплата за неполный рабочий день [15].
В основе этого были лаборатории патологии, вдохновленные успехом бактериологии в гражданской медицине и развитием общественного здравоохранения [16]. Дальновидный Королевский медицинский корпус готовил своих врачей по патологии и бактериологии с 1903 года, в то время как существование лабораторий патологии, которые развивались в течение войны, было названо Флетчером жизненно важным для «эффективности боевых сил» [17].
По этой причине, как только весной 1918 года в армии вспыхнула эпидемия гриппа, Военное министерство, Армейская медицинская служба (АМС) и Комитет по медицинским исследованиям пришли к выводу, что в случае выявления возбудителя гриппа можно разработать профилактическую вакцину для защиты солдат и, следовательно, военных интересов [18].
Военно-патологические лаборатории были созданы сэром Уильямом Бугом Лейшманом (1865–1926), профессиональным военным патологом, специалистом по тропической медицине и одним из основателей Комитета. Лейшман сыграл важную роль в том, что патологию начали интегрировать в военную медицину [19]. В октябре 1914 года он был назначен советником по патологии при начальнике АМС и инициировал создание патологических лабораторий во Франции и Фландрии. Лейшман руководил назначением почти ста патологов в восьмидесяти пяти больничных лабораториях во Франции и Фландрии, созданием состава из двадцати пяти передвижных патологических лабораторий и предоставлением ими услуг на фронте, а также образованием центральной исследовательской лаборатории в Булони.
Отделение патологии в Медицинском центре Королевского колледжа в Миллбанке, Лондон, было центром этой операции. Там обучали патологов и разрабатывали профилактические и терапевтические методы и вакцины против холеры, чумы и дизентерии. Эти вакцины, созданные в мирное время, имели еще большее значение во время войны. В результате развития вакцинации от инфекций умерло меньше солдат, чем в любой другой войне.
Центральную патологическую лабораторию АМС в Булони возглавлял сэр Алмрот Райт (1861–1947), ведущий патолог АМС. Два молодых помощника Райта – Александр Флеминг и Леонард Коулбрук – работали вместе с ним над раневыми инфекциями и антисептиками, а булонская лаборатория была связана с отделением прививок Райта в больнице Святой Марии в Паддингтоне.
Многие историки утверждают, что британские военные пытались скрыть эпидемию смертельного гриппа, задерживая сообщения о вспышке и утверждая, что она была испанского происхождения. Историк Майкл Бресалье, однако, считает, что это было не столько результатом цензуры, сколько следствием того факта, что военные врачи были искренне озадачены происхождением и сущностью этого нового штамма вируса гриппа.