Сюжет фильма рассказывает историю молодого человека по имени Томас Андерсон, который работает программистом, а по ночам превращается в хакера Нео. Однажды к нему приходит послание, в котором говорится: «Ты увяз в Матрице. Следуй за белым кроликом». Девушка с татуировкой кролика приглашает его в клуб, где он знакомится с Тринити, которая приводит Нео к Морфеусу. Капитан корабля «Навуходоносор» предлагает Нео выйти из Матрицы. Морфеус дает Нео две таблетки: приняв синюю, Нео проснется в своей постели, а приняв красную, он узнает правду. Нео выбирает красную таблетку и узнает, что на самом деле кажущийся реальностью мир — всего лишь иллюзия. Все люди закрыты в специальные капсулы, благодаря которым их тела вырабатываютт энергию, чтобы питать мир машин, поработивших Землю. Немногие проснувшиеся ведут повстанческую борьбу с машинами, центром цивилизации в реальном мире является тайный город Зион. Повстанцы делают вылазки из города на своих космических кораблях и ведут свою войну с машинами. За работой системы в иллюзорном мире следят агенты, которые на самом деле являются компьютерной программой, и именно они сейчас представляют собой главную опасность. Программист Томас Андерсон мучается одним только вопросом — почему именно ему решили раскрыть истину. Так он узнает о том, что Морфеус считает его Избранным спасти человечество. Сам Нео так вовсе не считает. Их посещение провидицы Пифии лишь убеждает Нео в том, что он не Избранный. Гадалка, однако, предупреждает его, что Нео придется сделать выбор между своей жизнью и жизнью Морфеуса. Именно в этот момент на них нападают агенты Матрицы. Нео и Тринити удается освободить взятого в плен Морфеуса, но в последний момент агент Матрицы удерживает Нео в иллюзорном мире, и тому приходится принять бой, из которого Нео выйдет победителем, Избранным. Заканчивается картина тем, что Нео обещает рассказать людям в Матрице о настоящем мире, в котором возможно все.
Кадр из фильма «Матрица». 1999 г.
Фильм «Матрица» был создан двумя невероятно странными и глубоко одинокими гиками для точно таких же, как и они, одиноких, замкнутых в себе людей, полностью погруженных в иллюзорный мир, сотканный из комиксов, сериалов, книг и фильмов массовой культуры. Именно таким станет мир спустя всего двадцать лет. Ларри Вачовски легко мог появиться на площадке в женской одежде или начать говорить о себе в женском роде. Нередко нечто подобное позволял себе и Энди. Практически все создатели вселенной «Матрицы» выглядели как сборище фриков — с косичками, фиолетовыми и зелеными волосами, татуировками и пирсингом; эти фрики как никто разбирались в своем деле и свысока разговаривали с продюсерами и спонсорами. И все эти «белые воротнички», у которых были деньги, вынуждены были идти на поводу у странных фриков.