Хотя катары и стремились к единой церковной организации, мы имеем массу свидетельств в пользу того, что у них, как и у богомилов, не имелось единой доктрины; в рамках одной и той же области могли существовать разные толки катарства. Они распределялись между крайностями онтологии и антропологии трактата «О двух началах», созданного в Северной Италии в первой половине XIII в. , и осторожным монодуа-лизмом. Предание о Сатанаиле, известное нам из богомильских источников, было распространено и среди катаров.
К сожалению, у нас существуют серьезные проблемы с источниками по катарской доктрине. «О двух началах» и т. н. «Пражский манускрипт» являются единственными сочинениями, которые показывают теоретический дискурс этих средневековых еретиков. Сохранившийся «Катарский требник» дает представление о литургической стороне движения, но не проливает свет на доктрину. Мы знаем, что у французских еретиков существовал компендиум богословских трудов (т. н. «Взвешенные учения»), но, к сожалению, он не сохранился. Многих из катаров католические источники характеризуют как плодовитых или даже «чрезвычайно плодовитых» писателей (например, Арнольда из Прованса, Иоанна де Луджио). Однако нам приходится пользоваться преимущественно свидетельствами католических обличителей еретиков и архивами инквизиционного суда, прекрасно отдавая себе отчет в сомнительности и преувеличенности многих из этих свидетельств.
Римско-католическая Церковь достаточно быстро оценила масштаб угрозы со стороны катаров. Уже в 1179 г. Третий Латеранский собор осудил это движение. В 1184 г. были изданы т. н. Веронские декреталии, согласно которым исповедание катарской ереси прирав нивалось к государственному преступлению. Все это создавало основу для полномасштабной борьбы с еретиками. В 1209 г. папа Иннокентий III призвал к крестовому походу против французских катаров. Его призыв стал началом т. н. «альбигойских войн» (1209–1244), результатом которых стало присоединение Лангедока к французскому королевскому домену. Помимо организации военного подавления еретиков, римское папство создало Святейшую инквизицию, а также поддержало возникновение т. н. «новых орденов» – доминиканского и францисканского, которые своей проповедью истинно христианской жизни сумели вернуть в церковное лоно значительное число сторонников катаров.
Во второй половине XIII в. катары перестали быть серьезной силой и совершенно утеряли организационное единство. После краткого ренессанса катарства на юге Франции, имевшего место на рубеже XIII-XIV вв., это движение исчезает со страниц истории.
Первые годы Альбигойских войн описал цистерианский монах Петр Сернейский (ум. после 1218), который был сторонником Симона де Монфора, выдающегося вождя крестоносных армий на юге Франции. Его «Альбигойская хроника» является не только бесценным историческим источником, но и важным свидетельством о катарском учении, структуре катарской общины и основных обрядах еретиков.