Недостатки ГЭС: 1) требуют больших капиталовложений на строительство; 2) имеют длительные сроки строительства; 3) их строительство связано на равнинах со значительными потерями земель, причем лучших – пойменных, отличающихся высоким плодородием; 4) доля ГЭС в производстве электроэнергии меньше, чем их доля в суммарной мощности всех электростанций; 5) при создании водохранилищ неизбежным является переселение жителей из затапливаемых населенных пунктов, что требует очень больших расходов; 6) при создании плотин на равнинной местности повышается уровень грунтовых вод, что ведет к заболачиванию и засолению почвы; 7) плотины мешают развитию рыбного хозяйства, они мешают миграции рыб (создаваемые рыбоходы дают малый эффект) и тем самым ухудшаются условия рыбоводства и рыболовства; 8) вода в водохранилищах (в отличие от речной, проточной) застаивается, становится накопителем грязи и вредных отходов (это особенно опасно в густонаселенных промышленных районах); 9) социально-психологические последствия от создания крупных водохранилищ при ГЭС; 10) выработка электроэнергии на ГЭС зависит от климатических условий и меняется по сезонам.
В связи со строительством ГЭС на Волге были созданы водохранилища. В связи со строительством водохранилищ режим реки в значительной мере зарегулирован. На берегах Волги созданы заповедники и национальные природные парки. Сохраняется тенденция увеличения площади и числа охраняемых природных территорий. Поскольку экологическое состояние Волги ухудшилось, в 1989 г. был учрежден общественный Комитет спасения Волги, постепенно увеличивается внимание государственных структур к решению экологических проблем этой великой русской реки.
Для хозяйства Костромской области ощутимое значение имеет созданное на р. Волге Нижегородское (Горьковское) водохранилище,
простирающееся в Костромской, Нижегородской, Ивановской, Ярославской областях. Это водохранилище образовано плотиной одноименной ГЭС, заполнено в 1955–1957 гг., его площадь 1590 кв. км, объем 8,8 куб. км, длина 427 км, наибольшая ширина 14 км. С созданием Нижегородского (Горьковского) водохранилища образовалось Костромское водохранилище в низовьях р. Костромы.Основные озера Костромской земли: Галичское (площадь 75,4 кв. км, длина 17 км, ширина 6 км, средняя глубина 1,8 м, максимальная глубина – до 5 м) и Чухломское (площадь около 50 кв. км, глубины не более 4,5 м). Эти озера имеют рыбопромысловое значение, но главное богатство в них – это слой озерных иловатых отложений, сапропель
, достигающий местами толщины 9 м. В Галичском озере запасы сапропеля составляют 400–500 млн т. Сапропель используют для удобрения полей, при химической переработке из него можно получать высококалорийный газ и другие продукты. 1 млн т сапропеля заменяет более 1 млн куб. м дров. Особенно ценно то, что галичский сапропель обладает высокими целебными качествами; местные лечебные грязи не хуже крымских, но об этом мало кто знает.
Костромское водохранилище