15 мая 1682 года, всего через две недели после воцарения Петра, стрельцы врываются в Кремль, убивают нескольких Нарышкиных и их сторонников. Три дня стрельцы и примкнувший к ним «черный люд», пришедший на Красную площадь «с ослопьем и дрекольем», чинили расправу над боярами, не разбирая уже ни Нарышкиных, ни Милославских, убивая всех, кто возбудил против себя народный гнев. В эти дни, как пишет один из современников, «Красная площадь упиталась кровью многих бояр, и думных, и ближних, и иных чинов людей».
По требованию стрельцов царями избираются оба царевича - Иван и Петр, а правительницей - их сестра царевна Софья. Стремясь закрепить победу, стрельцы водружают на Красной площади памятный столб. На нем были указаны поименно все убитые ими бояре, перечислены их вины и злодеяния, восславлены заслуги стрелецкого войска.
Среди московских стрельцов было немало явных и тайных сторонников старообрядчества, недовольных недавними церковными реформами патриарха Никона. Этим воспользовались духовные вожаки старообрядцев, чтобы потребовать восстановления старины.
Особую активность проявил расстриженный в 1681 году суздальский священник, друг известного протопопа Аввакума - Никита Константинович Добрынский, прозванный официальной церковью Пустосвятом. При поддержке начальника стрелецкого войска князя Хованского, заигрывавшего со старообрядцами, Никита Пустосвят добился назначения диспута между «никонианцами» и ревнителями церковной старины. Прения («пря») состоялись 5 июля 1682 года в Грановитой палате Кремля в присутствии высшего духовенства, многих бояр, обоих малолетних царей и царевны Софьи.
Как ни просторна Грановитая палата, она не могла вместить огромное множество стрельцов и посадских людей, живо интересовавшихся диспутом. Большая толпа собралась перед входом в Грановитую палату. Еще больше москвичей ожидали исхода диспута на Красной площади. В подавляющем большинстве они были настроены в пользу старообрядцев и вели себя очень активно. В патриарха Иоакима, когда он вышел из Успенского собора, даже бросали булыжниками. А Никиту Добрынского и его сподвижников толпа, напротив, приветствовала. Один из летописцев сообщает, что, когда Никита и его единомышленники проходили по Красной площади в Кремль, из толпы раздавались возгласы: «Не толсто де брюхо у них, не как у нынешнего нового завета учителей».
Ни одной из споривших сторон, понятно, не удалось переубедить противника. По окончании диспута Никита Пустосвят и его сторонники вышли на Красную площадь и с Лобного места стали горячо призывать народ вернуться к «древлему благочестию».
Такая дерзость старообрядцев вызвала негодование у царевны Софьи. Она приказала схватить Никиту Пустосвята, и через шесть дней после диспута он сложил свою буйную голову на Лобном месте под топором палача.
Это один из двух точно известных истории случаев, когда Лобное место использовалось как эшафот, и единственный случай, когда казнь на Лобном месте была совершена. В первом случае, когда на Лобное место был выведен Василий Шуйский, казнь, как мы уже говорили, была отменена.
Софья, многим обязанная стрельцам и их начальнику князю Хованскому, вскоре начала тяготиться их своеволием. Осенью того же 1682 года она обвинила Хованского в намерении уничтожить все царское семейство и самому стать царем. Хованский был арестован и казнен. Сразу же после этой казни Софья приказала срыть поставленный стрельцами столб. Он простоял на Красной площади всего четыре месяца.
В конце 1689 года произошел новый дворцовый переворот. 17-летний Петр берет власть в свои руки. Свою властолюбивую сестру Софью он заточает в Новодевичий монастырь.
Уже обозначившееся к этому времени стремление Петра к решительным преобразованиям, близость его с иноземцами, весь образ жизни молодого царя, резко отличный от привычного старомосковского уклада, вызывали острое недовольство родовой знати и консервативно настроенных слоев населения. Знаменем этих слоев стала царевна Софья, а реальной силой, на которую возлагали надежды ревнители старины, явились стрелецкие полки, недовольные появлением новых, регулярных войск, сформированных Петром.
В 1697 году Петр собирается в заграничное путешествие. Но накануне отъезда ему доносят, что стрелецкий полковник Иван Цыклер со своими друзьями по наущению Софьи замыслил убить его. Решительный Петр сам арестовал Цыклера и казнил его. Отрубленную голову Цыклера по приказу Петра привезли на Красную площадь, насадили на «железный рожон» и на несколько дней оставили так для устрашения заговорщиков. Вместе с Цыклером были казнены и другие участники заговора, среди них Федор Матвеевич Пушкин, предок нашего великого поэта. О стольнике Федоре Матвеевиче А. С. Пушкин вспоминает в своей «Родословной»:
Упрямства дух нам всем подгадил:
В родню свою неукротим,
С Петром мой пращур не поладил
И был за то повешен им.