Известна лишь одна попытка широких народных масс выступить против османов. Осенью 1526 г. серб Иован Черный, бывший когда-то «конным слугой» Яноша Запольяи, организовал объединенное боеспособное войско, в котором к началу 1527 г. насчитывалось 10–15 тыс. воинов, в основном сербов, которые переселились в начале 20-х годов в южные районы королевства Венгрии. К ним примкнули венгерские крестьяне и, по терминологии хрониста Яноша Зермега (1504–1584), «бродячие воины», видимо наемники различного этнического происхождения. Иован объявил себя потомком сербских деспотов и «ниспосланным богом» вождем борьбы против османов.
Учитывая боеспособность сербских воинов, Янош Запольяи направил войско Иована в районы южного Алфёлда для охраны границ. Местные феодалы рассматривали этих воинов из простонародья как нарушителей феодальных привилегий. Уже в конце 1526 г. местные сторонники Яноша Запольяи выступили против Иована: сначала потерпели поражение, а потом захватили столицу Иована — Сабадку (Суботицу). Поэтому осенью 1527 г. Иован Черный перешел на сторону Фердинанда I, рассчитывая на то, что тот будет вести войну против османов. Посланное Яношем войско под начальством воеводы Трансильвании Петера Переньи, состоявшее из дворян, саксов, крестьян из области Дьюлы, в апреле 1527 г. потерпело поражение от армии Иована: из 2 тыс. пехотинцев удалось спастись лишь 50; в бегство обратилась 10-тысячная конница.
Преследуя противника, сербы по долине Мароша вторглись в Трансильванию, дойдя до Хацега в Сасшебеша (современный Орэштие). Лишь 25 июня в битве у Седа самый опытный военачальник Яноша Имре Цибак разбил войско Иована, который бежал в Сегед, где против него выступили горожане. Иована поймали и казнили, войско его рассеяли, но не уничтожили полностью: 1 тыс. кавалеристов Янош принял к себе на службу в качестве наемников и в дальнейшем использовал в борьбе против Фердинанда I.
В движении Иована имелись элементы антифеодальной борьбы, связанные с выступлением против сербских воинов местного дворянства. Однако у нас нет, по-видимому, достаточных оснований квалифицировать эти события как антитурецкое и антифеодальное движение. Его значение состоит в том, что венгерское дворянство в критический момент борьбы с османами подчинило собственным классовым интересам дело защиты страны, выступив против народных масс, которые в силу своего социального и профессионального положения могли бороться против османской экспансии.
Руководство военными действиями осуществляли венгерские феодалы, состоявшие на службе у Габсбургов. Командование находилось в руках королевского и государственного главных капитанов (командующих). Первому подчинялись находившиеся в стране наемники, второй командовал дворянским ополчением и стоял во главе постоянного войска. Этот командующий был членом наместничества, которое в отсутствие короля в качестве его коллективного наместника являлось высшим центральным органом управления. В заседаниях Придворного военного совета, главной задачей которого было руководство войнами против османов, принимал участие один из советников органа финансового управления — Венской палаты (камеры). Палате отводилась определенная роль в обеспечении обороны материальными средствами.
В 1564 г. Фердинанд I разделил свои страны между сыновьями на три части. Непосредственно заинтересованные в борьбе против османов Венгрия, а также Чехия, Нижняя и Верхняя Австрия перешли под власть императора Максимилиана II (король Венгрии Максимилиан I, 1564–1576). Штирия, Каринтия и Крайна, которым также угрожали османы, достались эрцгерцогу Карлу (1540–1590). С 1577 г. пограничными крепостями Хорватии и Славонии руководили эрцгерцог Карл, Венгрии — эрцгерцог Эрнст (1553–1595), второй сын императора Максимилиана И. В Граце действовал особый военный совет, в ведении которого были крепости Хорватии и Славонии — так называемые вендские крепости. Венский Придворный военный совет ведал крепостями Венгрии. В 1590 г. Эрнст взял на себя руководство и хорватско-славонской линией обороны. Ранее линия крепостей была разделена между семью (шестью) главными капитанами (командующими). Они осуществляли военный суд, предоставляли военнослужащих военным и комитатским судам для исполнения их приговоров. Они командовали войсками, принимая участие в военных действиях.
Самую главную статью расходов страны составляло содержание линии крепостей. Подсчитано, что на это уходила вся сумма налога, собираемого с крестьянства. Самые же постоянные и устойчивые доходы — с регалий (с рудников и таможен) — шли на содержание королевского двора и на другие расходы королевской семьи.