В 1553–1555 гг. Сулейман был занят войной с персами, усмирением восставших янычар, борьбой с сыновьями, рвавшимися к власти. Поэтому задачу отрыва Трансильванского княжества от Габсбургов османские власти решали мирными средствами. В указанные годы Фердинанд и часть господствующего класса Трансильванского княжества рассматривали княжество в качестве владения Габсбургов. Дворянство Парциума подчинялось распоряжениям должностных лиц габсбургского королевства. Представители Трансильвании (воеводства) участвовали в заседаниях Государственного собрания королевства. Отстаивали свои привилегии, в частности право осуществлять непосредственную связь с королем, три господствующих слоя воеводства Трансильвания: дворяне семи трансильванских комитатов, патрициат немцев («саксов») так называемой Королевской земли и предводители секеев, ставшие к тому времени феодалами. Выходцы из влахов, получившие в силу королевского или княжеского пожалования дворянство, владели землей и крепостными крестьянами, считались вассалами князя и входили в состав общности («нацио») мадьярских дворян. Влашская общинная верхушка — воеводы, крайники, кнезы — находилась в феодальной зависимости от землевладельцев, составляя часть зависимого крестьянства различной этнической принадлежности и происхождения.
Подчинить Трансильванское княжество стремился и Фердинанд. Зимой 1552/53 г. он лишил сословия Трансильвании права самостоятельного созыва Государственного собрания. Перед этим, летом 1552 г., Фердинанд направил в княжество повое войско наемников. Если лишенные жалованья немецкие, итальянские и испанские наемники Джанбаттисты Кастальдо жили за счет грабежей, то новый контингент сжег города Коложвар (современный Клуж-Напока) и Дюлафехервар (современный Алба-Юлия).
По настоянию вновь назначенных Фердинандом воевод Трансильвании Иштвана Добо и Ференца Кенди осенью 1553 г. оттуда были выведены наемники. Кастальдо покинул княжество, но обоим воеводам пришлось бороться с протурецким движением части дворянства. Это движение появилось не только в результате ущемления привилегий господствующего класса Фердинандом, но и благодаря мерам османских властей.
Несмотря на протесты назначенного Фердинандом воеводы, летом 1552 г. Государственное собрание, опасаясь султапской мести, решило продолжить уплату дани султану. Летом следующего года собрание дворян ряда областей высказалось за возвращение Яноша Жигмонда и Изабеллы.
Примирения с султаном добивались и трансильванские сторонники Фердинанда, ставшего в 1556 г. императором. Приняв точку зрения господствующего класса Трансильвании, Фердинанд в апреле 1555 г. направил от своего имени посольство к султану с данью за Трансильванское княжество. Конечной целью Фердинанда было сосредоточение в своих руках власти над всей Венгрией. Поэтому не вызывает удивления предложение другого посла Фердинанда: Вена готова была платить султану дань в 140 тыс. флоринов, если султан уступит всю Венгрию.
В ответ на это предложение закончивший войну с персами Сулейман потребовал от Фердинанда I до ноября оставить Трансильванское княжество. Одновременно он направил ультиматум господствующему классу княжества: Порта снова возьмет княжество под свою защиту и покровительство, если Янош Жигмонд и его мать будут возвращены в Трансильванию, в противном случае страна будет стерта с лица земли. От Фердинанда Порта истребовала передать Яношу Жигмонду территорию княжества, а также города Кашшу (современный Кошице), Надьварад (современный Орадя Маре) и Дьюлу. В декабре 1556 г. император уклонил просьбу трансильванских сословий о помощи. 1 июня следующего года Государственное собрание приняло решение о возвращении Яноша Жигмонда и Изабеллы. Фердинанду пришлось отступить.
В письме султану от 14 июня 1556 г. Фердинанд сообщал, что он передает Трансильванию Яношу Жигмонду. К этому заявлению его вынуждало только отсутствие сил для удержания княжества, но и наступление османского войска в Задунавье: стратегически важная крепость Спгетвар, прикрывавшая подступы к Австрии, с 20 мая по 31 июля осаждалась войсками султана. Чтобы отвлечь от Сигетвара это войско, военачальники Фердинанда палатин Тамаш Надашди и бан Хорватии Миклош Зриньи (Никола Зринский) (ок. 1508–1566) с 10-тысячным отрядом начали военные действия против занимаемой османами крепости Бабоча. Защитники Сигетвара отбили четыре штурма и смелыми вылазками нанесли османам большой урон. Войско паши Али, поспешившее на выручку Бабочи, 22 июля было разбито Тамашем Надашди.
В это же время сторонник Яноша Петер Петрович с помощью отрядов воевод Молдавского княжества и Валахии захватил крепости Трансильвании. 22 октября 1556 г. Изабелла и Янош Жигмонд торжественно въехали в Коложвар. Под власть вассала султана Яноша Жигмонда кроме Затисья (Парциума) перешли северные комитаты Среднего Подунавья — Гёмёр, Торна, Абауй, Земплен.