Ордены представляли собой настоящие военные организации с разветвленной иерархической структурой и строгой дисциплиной. Система их внутреннего устройства, которую выработали тамплиеры и госпитальеры, послужила образцом для других рыцарских корпораций. Во главе них стоял великий магистр, которому помогали великие оффициалы на местах, наставлявшие братьев-капелланов, рыцарей и сержантов. Орденские дома (командорства), которые возникают повсюду — и в Святой Земле, и в Западной и Северной Европе, и во франкской Греции, — объединялись в приорства, а те, в свою очередь, в «языки», или провинции. Командорства должны были предоставлять центральному руководству деньги и людей в случае войны. Некоторые из орденов, как-то: тамплиеры и госпитальеры — подчинялись непосредственно папе и обладали многочисленными привилегиями и богатствами вследствие пожалований, которые осуществляли в их пользу Церковь и светские государи Запада и латинского Востока. Располагая крупной собственностью по обе стороны моря, тамплиеры с середины XII в. начинают играть роль «банкиров» средневековой Европы, занимаясь кредитными операциями. Благодаря своему богатству, они могли лучше, чем латинские бароны, мобилизовать ресурсы для ведения боевых действий. Именно духовно-рыцарские ордена были основной, а в XIII в. едва ли не единственной военной силой в государстве крестоносцев. На протяжении существования государства крестоносцев ордены обеспечивали постоянное присутствие в Святой Земле армии и флота. В XII в. тамплиеры и госпитальеры могли выставлять армию в 500 рыцарей, находящихся в полной боевой готовности. И они все больше привлекались правителями латинского Востока к охране, содержанию и строительству военных крепостей и замков. Уже в середине XII в. им принадлежат знаменитая крепость Крак-де-Шевалье и ближайшая к ней Кастель Блан, замки Тортоза и Бельвуар и многие другие цитадели в Сирии и Палестине. В XIII в. рыцари получают новые замки в Ливане и Сирии — Маргат, Сидон, Бофор и др. В это время ордены охраняют и построенные франками в Палестине крепости — например, тамплиеры защищают Шато-Пелерен, — в то время как рыцари-тевтонцы контролируют выстроенную ими крепость Монфор, ставшую их первой резиденцией. С середины XIII в. эти замки и крепости, охраняемые храмовниками и иоаннитами, создавали главную линию фортификации Святой Земли, и в го время только духовно-рыцарские ордена сдерживали экспансию мамлюков, изо всех сил защищая латинские владения и последний оплот христиан на Востоке — город Акру. Несмотря на попытки военно-монашеских орденов охранять границы латинских владений, центробежные силы в целом возобладали на латинском Востоке над центростремительными, что в конечном итоге привело к краху эфемерных государств крестоносцев в конце XIII в. Только Кипрское королевство, которое явилось побочным продуктом Третьего крестового похода, продержалось еще два столетия, достигнув своего расцвета во время правления династии Лузиньянов, но в 1489 г. перешло Венеции, чтобы в 1570 г. оказаться в руках Османской империи.
Совсем другую картину представляет собой Латинская Романия — так называли на христианском Западе владения крестоносцев и итальянских морских республик на территории бывшей Византийской империи. Как известно, после завоевания Константинополя греческие земли были разделены в основном между венецианской олигархией и французскими баронами. В результате на месте Византии появилась Латинская империя (в ее состав вошли Константинополь, часть Фракии и острова в Эгейском море) во главе с избранным императором Бодуэном Фландрским, Фессалоникское королевство в северной Греции, где правителем стал Бонифаций Монферратский, а также вассальные от Фессалоникского государства Ахейское княжество (Морея), где правили шампанские сеньоры, Афинское герцогство, основателями которого были бургундцы, и др.
Обширные владения получили венецианцы — целый квартал в византийской столице, часть прибрежья Ионического и Адриатического морей, несколько крупных островов, среди которых Крит, Эвбея и др. На островах Эгейского моря венецианцы образовали герцогство Наксосское, или герцогство Архипелага, зависевшее от Латинской империи. Так Греция и острова Архипелага покрылись феодальными княжествами. Но со всех сторон франкские владения были окружены недавно образованными греческими государствами, где правили изгнанные византийские государи: Эпирский деспотат на Балканах, Трапезундская и Никейская империи в Малой Азии. На севере крестоносцам угрожал грозный сосед — царь Болгарии Калоян.