Разнородный подбор подразумевает собой спаривание особей, имеющих разнотипные признаки. В этом случае пары подбирают таким образом, чтобы самец был лишен определенных недостатков крольчихи, а та, в свою очередь, имела бы ряд желаемых достоинств и не обладала бы недостатками самца. В этом случае нужно быть очень внимательным, чтобы не подобрать животных с одинаковыми недостатками или же с достаточно серьезными отклонениями от нормы. За счет использования такой технологии подбора значительно увеличиваются жизнеспособность, крепость и продуктивность потомства. Помимо этого, в значительной степени увеличиваются приспосабливаемость и изменчивость крольчат. Если в ходе такой селекционной работы появляются отдельные особи с выделяющимися позитивными признаками, то их необходимо закреплять в потомстве, причем делают это с помощью однородного подбора.
В случае разнородного подбора нужно использовать животных, достаточно сильно отличающихся друг от друга по целому ряду признаков: по конституции, продуктивности (например, можно попытаться скрестить мясных кроликов с особями шкурного типа), происхождению, возрасту (в этом случае к молодым крольчихам подсаживают более старших самцов, возраст которых составляет 1,5 или 2 года) и т. д.
При племенном подборе иногда выделяют индивидуальный и групповой подборы. Индивидуальный подбор осуществляют в специальной селекционной группе или же в пользовательском стаде. В этом случае к самкам подсаживают максимально эффективного производителя, от которого получается потомство достаточно высокого уровня. Если в результате такого подбора будет получен положительный эффект, то это сочетание спаривания можно будет повторить.
При групповом подборе к крольчихам определенного уровня подсаживают кроликов, находящихся на порядок выше по своим показателям.
В кролиководстве используют два основных метода разведения: чистопородное и скрещивание.
Чистопородным называется скрещивание, при котором спаривание происходит в рамках одной породы. За счет этого можно добиться максимальной наследственной устойчивости особей, а также в значительной степени усовершенствовать породу по признакам, которые могут сильно пригодиться в хозяйственной деятельности. Наивысшей формой такого скрещивания является разведение кроликов по линиям и семействам. Линия — это животные, которые ведут свой род от одного общего предка (самца). У них есть целый ряд признаков, характерных именно для такой группы, причем все эти признаки передаются по наследству из поколения в поколение. Если же общий предок крольчиха, то это уже называется семейством.
При закладывании линий, а также для того, чтобы поддерживать в тонусе у животных племенные и продуктивные качества, прибегают к родственным скрещиваниям в умеренных степенях. Иногда этим же методом пользуются, чтобы вывести какую-нибудь новую породу. В этом случае, как уже говорилось ранее, необходимо производить максимально жесткую выбраковку, после которой остаются только кролики, идеально отвечающие целому ряду требований. Если регулярно использовать родственные спаривания, то это может привести к тому, что плодовитость начнет заметно падать, среди новорожденных крольчат будут появляться уроды и мертворожденные, а уровень жизнеспособности очень сильно понизится. Когда требуется определить степень родства, надо воспользоваться родословной особи. В ней следует найти ряд, где попадаются общие предки.
Крайне нежелательно, чтобы повторялись частые родственные спаривания — вполне допустимо спаривать родственников через каждые 4 или 5 поколений. Племенную работу среди кроликов нужно производить раздельно по отцовским и материнским линиям. По линии самцов в первую очередь обращают внимание на жизнеспособность, скороспелость, а также на качество шкурок. По материнской линии смотрят на воспроизводительные качества, плодовитость, количество молока и на материнские качества. В этом случае на скороспелость и качество шкурок особого внимания не обращают, а принимают эти показатели равными усредненным по стаду.
Кроликов различных линий можно спаривать между собой, чтобы получить межлинейные гибриды, которые от основных линий будут отличаться увеличенной скороспелостью или жизнеспособностью.
Зачастую вместе с чистопородным разведением используют скрещивание. В этом случае происходит спаривание животных, которые принадлежат к разным породам. Такое разведение кроликов используют в большинстве случаев, для того чтобы вывести какую-нибудь новую породу или улучшить уже существующую. В зависимости от цели скрещивания, их делят на несколько групп: промышленную, переменную, воспроизводительную, поглотительную и вводную. Потомство, полученное в результате такого скрещивания, называется помесью.