Фрайдорфская авиагруппа успела произвести 37 боевых вылетов, после чего 119-й авиационный полк из села Донузлав перебазировался в бухту Матюшенко, 4-я эскадрилья 8-го авиаполка — с аэродрома Ку-Нань на аэродром Херсонесский маяк. Из-за плохих погодных условий в ночь на 29 октября интенсивность своих ударов снизила и гидроавиация. В воздух поднялось только восемь МБР-2, но и те не смогли нанести удар по противнику и с бомбами вернулись на базу. При этом один гидросамолет разбился у мыса Казантип, а другой совершил вынужденную посадку в Темрюкском заливе.
Вечером 29 октября командующий вооруженными силами Крыма вице-адмирал Левченко издал директиву № 1/00260/07, которой объявлялось, что «
Отступление предполагалось осуществлять с использованием системы промежуточных рубежей. На них армия должна была ожидать подхода основных сил противника, но вести бой не с ними, а лишь с передовыми отрядами. После того как противник сосредотачивал против промежуточного рубежа крупные силы, наши части должны были по приказу отступать на следующий, оставив сильное прикрытие. Подобной тактикой планировалось замедлить продвижение противника, выиграть время, необходимое для подхода резервов и подготовки к обороне основного рубежа.
Смысл назначения промежуточных рубежей в самой директиве объяснен не был, но указывалось, что отход с рубежа на рубеж возможно производить только с разрешения Военного совета.
9-й СК, прикрываясь частями 276-й СД, должен был к утру 30 октября отойти на рубеж Ногайлы — Тархан-Шавва, выведя при этом в резерв «
Приморская армия, которой передавалась 156-я СД 9-го корпуса, должна была к утру 30 октября, оставив сильное прикрытие на занимаемых рубежах, отойти на рубеж Кончи — Айбары — Бозогу — Прикуп. При этом она должна была сосредоточить одну стрелковую дивизию в резерве в районе Алача и не менее полка в районе совхоза Симферопольский, в котором должен был развернуться ее командный пункт. Промежуточным рубежом для Приморской армии был определен район нахождения дивизионных резервов. В армейский резерв, который во время контрудара Приморской армии составляла одна 421-я СД, теперь были выделены еще две стрелковые дивизии — 320-я и 184-я. Кроме того, в резерв выделялась и 7-я бригада морской пехоты, которую надлежало развернуть с 421-й СД в районе Кадыр-Балы.
Так как после неудачного наступления Приморской армии, завершившегося ее разгромом, сплошной фронт просто перестал существовать, возникла угроза, что противник сумеет воспользоваться создавшимся положением и прорвется вглубь Крыма.
Существовала возможность прорыва противника к Севастополю, который не оборонялся армейскими частями, полностью переброшенными на Перекоп. Поэтому ЧФ было приказано немедленно занять собственными силами сухопутный обвод главной базы, выделив прикрывающие части и на рубеж реки Альма.
Немцы и их союзники имели возможность действовать и на других направлениях. Для немедленной обороны Ялты, Феодосии и Керчи просто не было сил. Поэтому было решено привести Ялту, Феодосию и Керчь в состояние полной боевой готовности, использовав для этого все наличные силы, от гарнизонов и комендатур до истребительных батальонов. Так как дальнейшее направление наступления противника было пока неизвестно, флоту вменялось в обязанность быть готовым к оказанию содействия сухопутным войскам на обоих флангах, а заодно и обеспечить северную часть Керченского полуострова от высадки морских десантов со стороны Азовского моря.
Одновременно полным ходом разворачивалась и эвакуация тылов армии. В первую очередь надлежало вывезти раненых, а затем — все излишнее и ненужное (ЦАМО РФ, ф. 406, оп. 9837, д. 2, л. 172).
Развал фронта (30 октября)