Левее Алуштинское шоссе прикрывала 421-я СД; правее, Судакское направление — 48-я КД генерал-майора Аверкина. Между дивизиями имелись большие разрывы, но они все-таки удерживали свои позиции и не позволяли немцам обойти обе отступающие армии. Но взаимодействия между дивизиями не было, как и не было управления отходящими частями 51-й армии.
Тем не менее большинство командиров отступающих дивизий по собственной инициативе стремились выйти к Ак-Монайским позициям, надеясь, что противника удастся остановить именно на них. Это было связано с тем, что штаб 51-й армии практически дезинформировал командование своих дивизий, сильно преувеличив оборонительную ценность Ак-Монайского рубежа. Как вспоминал командир 106-й СД полковник Первушин, «
Первые части 51-й армии вышли к Ак-Монайской позиции уже 1 ноября. Но, как сообщил в штаб ЧФ командир Керченской военно-морской базы, они выходили и к Керчи мелкими группами. Так, из 157-й дивизии в этот день к городу вышло около 300 человек, а еще 31 октября тыловые группы отходивших войск появились у переправы в Еникале.
На самих позициях не было представителей командования 51-й армии, и подходившие части никто не встречал, не назначал им оборонительных участков. Не была проложена связь. Отсутствовали запасы продовольствия и боеприпасов. Дивизионная артиллерия имела всего по нескольку снарядов на орудие, часто это уже был неприкосновенный запас, возимый в передке для самообороны орудия. А в штаб войск Крыма не поступало информации об их нахождении на позициях. Первые сообщения о занятых рубежах стали поступать только 5 ноября.
Для постоянной поддержки 9-го корпуса командование Азовской военной флотилии выделило четыре канонерские лодки, которые, сменяя друг друга, должны были постоянно дежурить у Арабатской стрелки. Туда же была направлена и часть кораблей Дунайской военной флотилии. При этом кораблям обеих флотилий надлежало находиться лишь у северной части Керченского полуострова и не разрешалось, обойдя Керчь с юга, приблизиться к Феодосии — они должны были одновременно стеречь северную часть Керченского полуострова от высадки возможных десантов противника.
Это могло помочь при обороне Ак-Монайской позиции, но не Феодосии, расположенной слишком далеко от зоны действия кораблей АВФ. Поэтому из Феодосии спешно эвакуировались те тылы флотских частей, которые в ней еще оставались. 3 ноября в районе Керчи сосредоточились практически все дивизии 51-й армии. Но удерживать неукрепленную Феодосию ослабленными частями не было никакой возможности, и к 15 часам дня она и поселок Дальняя Байбуга были без боя оставлены частями 9-го корпуса. Через четыре часа Феодосию заняли немцы.
Самолеты флотской авиации, в том числе и 20 МБР Керченской группы, в этот день не наносили ударов по наступающему противнику. Их задействовали под Севастополем, который до подхода частей Приморской армии приходилось защищать лишь слабовооруженными подразделениями морской пехоты.
Корабли Азовской и Дунайской флотилий, напротив, очень активно обстреливали быстро продвигавшихся вперед немцев. Немецкое командование сразу осознало потенциальную угрозу и, воспользовавшись отсутствием в воздухе советской авиации, решило покончить с кораблями еще до штурма Ак-Монайской позиции. Весь день немецкая авиация бомбила корабли обеих флотилий, но не смогла добиться значительных успехов. Пикировщикам удалось вывести из строя лишь 100-мм плавучую батарею № 4 ДВФ, получившую прямое попадание бомбы в корму.