В завершение провозглашалось: «Возвещаем жителям тех мест силою сего нашего императорского манифеста таковую бытия их перемену, обещаем свято и непоколебимо за себя и за преемников престола нашего содержать их наравне с природными нашими подданными, охранять и защищать их лица, имущество, храмы и природную веру, коей свободное отправление со всеми законными обрядами пребудет неприкосновенно, и дозволить напоследок каждому из них состоянию все те правости и преимущества, каковыми таковое в России пользуется; напротив чего от благодарности новых наших подданных требуем и ожидаем мы, что они в счастливом своем превращении из мятежа и неустройства в мир, тишину и порядок законный потщатся верностью, усердием и благонравием уподобиться древним нашим подданным и заслуживать наравне с ними монаршую нашу милость и щедроту [8 апреля 1783 г. ]».
В июне 1783 г. прибывший в Крым Г. А. Потемкин на плоской вершине знаменитой Белой Скалы близ Карасубазара принял от беев, мурз и представителей всех сословий присягу на верность государыне и Российской империи.
Недолгое время бывший главой местной администрации генерал О. А. Игельстром сформировал «Таврическое областное правление», в которое, наряду с новыми администраторами и опытными ханскими чиновниками, вошла высшая татарская знать.
С моря ввод дополнительных российских войск прикрывал фрегат «Осторожный» под командованием капитана 2 ранга И. М. Берсенева. В его задачу входило также определить удобную стоянку для кораблей будущего флота. Он нашел таковую – там, где когда-то высился Херсонес, в расположенной поблизости бухте.
По указу Екатерины там незамедлительно началось строительство береговой обороны, верфей, доков, причалов, Адмиралтейства и прочих сооружений. Так рождался Севастополь. Вскоре сюда пришли корабли Азовской, а потом Днепровской флотилий.
Согласно манифесту императрицы, сохранялись все имущественные права, а также традиционные отношения внутри татарских и ногайских родов. Знать получила права российского дворянства, за нею сохранилась земельная собственность (и пошли плодиться на Руси Ширинские, Мансуровы и прочие аристократы). В 1787 г. собравшиеся со всего Крыма авторитетнейшие мурзы провели выборы уездных предводителей дворянства.
Рядовые татары получили статус государственных (лично свободных) крестьян, крепостнических отношений в Крыму не возникло. Ханская собственность перешла в казну, но лично Шагин Гирей внакладе не остался.
В Крыму было 12 городов и около 1400 аулов и деревень. Массового оттока жителей не было, он произойдет позже, после новой русско-турецкой войны.
В феврале 1784 г. указом императрицы на территории бывшего Крымского ханства была образована Таврическая область (включавшая Крымский полуостров, Таманский полуостров и некоторые прилегающие к Перекопу степные районы) с центром в Симферополе. Первым правителем ее стал генерал-аншеф М. В. Каховский.
В 1796 г. область вошла в обширную Новороссийскую губернию, из которой в 1802 г. была выделена Таврическая губерния, включающая Крым и еще три уезда, площадь которых в сумме была примерно равна площади полуострова. Губерния просуществовала до 1921 г.
В год присоединения поблизости от Крыма, на Кубани, произошли трагические события, отношение к которым историков, а тем более политиков и идеологов национальных движений неоднозначное. Некоторые говорят о «геноциде ногайского народа», в котором обвиняют А. В. Суворова.
В степи между Кубанью и притоком Дона Манычем кочевали ногайские орды, перешедшие сюда из Прикаспия. Они находились в постоянной кровавой вражде с горными черкесами: ногайцы обвиняли горцев в том, что те угоняют их скот, те их – в похищении людей для продажи. Ногайским набегам подверглись также донские и терские казаки, подданные Российской империи, и воинские части Кубанской линии.
Возник план переселения орды на «историческую родину» – в степи за рекой Уралом. Руководить операцией было поручено Суворову. Переселение было согласовано им с ногайскими мурзами. Но при активной подначке Османской империи вспыхнуло восстание, сопровождавшееся новыми нападениями на казачьи станицы и регулярные русские войска.
В ночь на 1 октября 1783 г. у селения Керменчик Суворов нанес ногайцам неожиданный удар силами армии и казачьих отрядов. Потери ногайцев были очень велики (приводятся данные от 5 до 12 тысяч и выше), в том числе погибло много мирного населения. Согласно донесению Суворова, загнанные в болото, отчаявшиеся ногайские воины сами стали резать своих жен и детей, чтобы те не попали в плен, но не все этому источнику доверяют.
Переселение не состоялось, часть ногайцев ушла в Турцию, часть нашла прибежище у своих заклятых врагов, черкесов, часть осталась кочевать здесь же – и не раз еще поднимала восстания.
Последнему хану Крыма в благодарность за беспроблемный отказ от власти и как компенсация за отобранные в казну владения была назначена пенсия в 200 тысяч рублей в год, правительство обещало изыскать для него ханство в Персии.