2 ноября испанский военный комендант Сантьяго генерал Хуан Бурриэль собрал в крепости Долорес военный совет, который объявил всех захваченных пиратами и постановил расстрелять их главарей без суда и следствия. На рассвете 4 ноября были расстреляны Барнабе Варона, Педро Сеспедес, Хесус дель Соль и Уильям Райан.
7 ноября 1873 года Антонио Фернандес, командующий военно-морскими силами в Сантьяго, приказал также без суда и следствия расстрелять двенадцать захваченных кубинцев. Их казнили на следующее утро.
Затем, в ночь с 7 на 8 ноября, на борту стоявшего в гавани военного корабля «Сан-Франциско де Борха» трибунал под председательством командира этого корабля Нарцисо Фернандеса Педруньяна вынес приговор о расстреле капитана Фрая и 36 других моряков «Вирджиниуса», включая двух коков и судового врача. Двенадцать американских моряков (включая двух несовершеннолетних юнг) были приговорены к тюремному заключению, трое (квартирмейстер, начальник машинного склада и юнга) были оправданы. Несмотря на протест американского вице-консула в Сантьяго, 8 ноября 37 моряков были расстреляны.
Когда на Ямайке стало известно о расстрелах, старший британский морской начальник в Кингстоне коммодор Элджернон де Хорси отправил в Сантьяго-де-Куба шлюп «Ниобе» под командованием Ламбертона Лорейна. Лорейн явился к генералу Бурриэлю и заявил:
– Сэр, у меня нет указаний от моего правительства, потому что оно еще не знает о происходящем, но я беру на себя ответственность и убежден, что мое поведение будет одобрено Ее Британским Величеством, потому что мои действия направлены на соблюдение гуманности и цивилизованности. Я требую, чтобы вы прекратили ужасную бойню, которая здесь происходит. Я верю, что мне не нужно объяснять, каковы будут мои действия, если мое требование не будет исполнено.
Однако к этому времени все приговоренные были уже казнены.
Когда о расстрелах стало известно в США, президент США Улисс Грант срочно собрал кабинет министров. 8 ноября государственный секретарь США Гамильтон Фиш встретился с испанским послом Хосе Поло де Барнабе и выразил ему свою обеспокоенность. 11 ноября кабинет министров США принял решение о возможности американской интервенции на Кубу. Несколько бывших командиров Гражданской войны, как южан, так и северян, обратились к президенту Гранту с предложениями организовать отряды американских добровольцев для высадки на Кубе.
Госсекретарь Гамильтон Фиш приказал американскому послу в Мадриде Дэниэлу Сиклзу требовать от испанского правительства выдачи уцелевших арестованных и уплаты репараций. 14 ноября кабинет министров США решил разорвать дипломатические отношения с Испанией, если Испания откажется платить репарации. Президент Грант объявил о приведении флота США в боевую готовность, военно-морской министр Джордж Робсон распорядился сосредоточить в Ки-Уэсте основную часть американской Северо-Атлантической эскадры.
От испанцев потребовали вернуть «Вирджиниус», освободить всех оставшихся в живых арестованных, принести официальные извинения, а главное – наказать ответственных за казни и выплатить компенсации семьям казненных.
28 ноября 1873 года Гамильтон Фиш и испанский посол Хосе Поло де Барнабе заключили соглашение, по которому «Вирджиниус» и его экипаж возвращались в США, а обе стороны обязались провести расследование законности действий хозяев парохода и испанских властей на Кубе.
3 декабря группа оставшихся в живых моряков с «Вирджиниуса» была доставлена на британский шлюп «Ниобе». 17 декабря 1873 года «Вирджиниус» был передан американцам и отбуксирован в Ки-Уэст.
18 декабря все оставшиеся в живых с «Вирджиниуса» (102 человека, включая кубинцев) были приведены на американский корвет «Хуанита», а тот доставил их в Нью-Йорк.
После долгих переговоров Испания согласилась выплатить компенсации семьям казненных. При этом семьи чернокожих британцев получили меньше, чем семьи белых, семьи же американцев получили равные компенсации вне зависимости от цвета кожи. Приказ о расстреле захваченных на «Вирджиниусе» испанские власти признали преступным, коменданта Хуана Бурриэля отдали под суд, но он умер 22 декабря 1877 года, то есть до начала процесса.
Игнасио Аграмонте-и-Лойнас в апреле 1870 года из-за разногласий с Сеспедесом о способах ведения войны подал в отставку, хотя и продолжил участвовать в боях. В начале 1871 года Карлос Мануэль де Сеспедес вновь предложил ему возглавить военный штаб Камагуэя. 17 января отважный Аграмонте приступил к исполнению своих обязанностей, и вскоре в боевых действиях стало наблюдаться прогрессирующее улучшение. Силы повстанцев перешли от обороны к наступлению.