Территория Литвы была разделена на четыре областных комиссариата (Landgebiet)
— Вильнюсский, Каунасский, Паневежский и Шяуляйский и на два городских — Вильнюс и Каунас, на 25 уездов и на 290 волостей{29}. Во главе каждого областного комиссариата стояли подвластные генеральному комиссару областные (или городские) комисары (Gebietskommissar). Областным комиссаром Вильнюса (Gebietskommissar Wilna Land) был назначен штурмбаннфюрер СС Хорст Вульфф (Horst Wulff), городским комиссаром Вильнюса (Gebietskommissar Wilna — Stadt) — штурмбаннфюрер CA Ганс Хингст (Hans Hingst), областным комиссаром Каунаса (Gebietskommissar Kauen — Land) — оберфюрер CA Арнольд Лентцен (Arnold Lentzen), городским комиссаром Каунаса (Gebietskommissar Kauen — Stadt) — оберфюрер CA Ганс Крамер (Hans Cramer), областным комиссаром Шяуляя (Gebietskommissar Schaulen) — крейсляйтер НСДАП Ганс Гевеке (Hans Gewecke). Созданным в ноябре 1941 г. областным комиссариатом Паневежис (Gebietskommissar Panewesch) руководил штурмбаннфюрер СС Вальтер Неум (Walter Neum). До того времени (до ноября 1941 г. — Примеч. редактора) всей Северной Литвой руководил шяуляйский областной комиссар. По состоянию на 17 января 1942 г., в генеральном комиссариате Литвы работали 275 мужчин и 150 женщин, а в гебитскомиссариатах — 285 мужчин и 200 женщин{30}.
Основной функцией немецкой гражданской администрации в Литве было присмотр за литовским самоуправлением (Aufsichstverwaltung).
Так, гебитскомиссары, педантично присматривая за начальниками уездов и войтами волостей, обязаны были осуществлять управление Генерального округа Литвы в соответствии с целями немецкого руководства. Достичь этого им активно помогало немецкое руководство СС и полиции. Высшей полицейской инстанцией имперского комиссариата был высший руководитель СС и полиции «Остланд» (Höhere SS und Polizeifūhrer Ostland), которому были подчинены части войск СС, полиция порядка (а через её руководство и национальная полиция занятых областей) и в какой-то мере полиция безопасности и служба безопасности. На основании подписанного 17 июля 1941 г. А. Гитлером указа «О гражданском управлении в занятых Восточных областях» высший руководитель СС и полиции имперского комиссариата «Остланд» был подчинён рейхскомиссару Остланда, руководитель СС и полиции (SS undPolizeführer) генерального округа был подчинён генеральному комиссару, а руководители полиции низшего уровня — областным комиссарам (данное утверждение автора весьма спорно. — Примеч. редактора). В то же время вышеупомянутый декрет А. Гитлера установил, что полицейскую охрану на занятой территории обеспечивают рейхсфюрер СС и начальник немецкой полиции Генрих Гиммлер (Heinrich Himmler), который в свою очередь был уполномочен давать соответствующие указания комиссарам. Создалась ситуация, когда вожди СС и полиции были включены в штабы комиссаров, однако их присутствие там было формальным. Специальные полицейские полномочия, которые они получили от Г. Гиммлера, создавали впечатление, что это комиссары должны быть подчинены им, а не наоборот. Таким образом, полицейский механизм управления создал вторую, независимую от гражданской администрации, систему управления. Не был исключением и Генеральный округ Литвы. Надо отметить, что 19 ноября 1941 г. Г. Гиммлер и А. Розенберг достигли договорённости, по которой при отсутствии руководителя гражданской администрации (командировка, смерть, отстранение и т.д.) его замещает руководитель СС и полиции соответствующей территории{31}. Этим же соглашением была определена компетенция руководителей СС и полиции в Остланде: в их распоряжении были не только формирования немецкой полиции, но и силы местной полиции, так называемой Schutzmannschaften{32}.