На юге Литвы, где влияние LLA практически не ощущалось, также происходили аналогичные процессы — создавались крупные дружины (порой даже мобильные), из которых, наконец, были сформированы Дайнавский район и Таурасский район в Сувалкии. Именно в районе партизан Южной Литвы, который также появился самым ранним, возникла не только идея сформировать общее руководство, но и были предприняты реальные действия для достижения этого. На это также повлияла появившаяся возможность установить контакты с политиками и лидерами, которые уехали на Запад.
Деятельность в этот период была особенно активной: крупные подразделения могли не только сражаться с многочисленными силами противника, но и контролировать сельские районы Литвы, где система стрибая и милиции еще не была установлена, где все еще не было агентов и некому было их вербовать. Партизаны без особых усилий захватывали города, центры сельских округов, тюрьмы, оставались там в течение дня и благополучно уходили. Это вдохновило простых людей и подняло их дух — обязательства по поставке сельскохозяйственной продукции массово игнорировались, люди прятались, чтобы избежать призыва в Красную Армию, пополняя таким образом многочисленные партизанские отряды. были перекрыты дороги, устраивались засады, в лесах были установлены огромные бункеры, в которых поместились бы лошади, повозки и даже оставшиеся пушки (например, в укрытии в Отряд Пабарчюса в Палепяях лесу). Крупные сражения происходили почти по всей Литве уже с конца 1944 года до зимы 1945 года. В конце 1945 года тактика партизан начала меняться — необходимость выжить вынудила сократить численность подразделений, более того, многие случайные скрывающиеся лица ушли, которые после первых крупных сражений начали легальную жизнь или спрятались дома, где было безопаснее. Подсчитано, что в начале 1945 года в лесах находилось, вероятно, около 30 000 человек. Это число может быть реальным, если в него также включить лиц, скрывающихся от призыва на военную службу и не имеющих намерения воевать в течение длительного времени. Это также косвенно подтверждается статистикой НКВД, которая гласит, что из 23 700 человек, которые были убиты, арестованы или получили легальный статус, только 60 процентов были вооружены. Заявление главы четвертого отдела в 1957 году ЛССР Николай Вуколов из КГБ о процессе легализации в Литве в 1945-1957 годах свидетельствует то же самое; в нем говорится, что после директивы Верховного Совета СССР от 7 июля 1945 года об амнистии лицам, уклонившимся от военной службы в советской армии или дезертировавшим из нее, и обращения Президиума Верховного Совета ЛССР, Совета Министров и Правительства LCPIB] CC от 5 марта 1946 года для лиц, находящихся на нелегальном положении, с предложением им стать законными гражданами в учреждениях Министерства внутренних дел, за весь период легализовалось 38 838 человек (из них 8 350 были вооруженными «членами националистических банд», в то время как 30 488 были дезертирами, уклоняющимися от призыва в советскую армию). «Нет сомнений, что часть тех, кого причислили к «бандитам» и «буржуазным националистам», были не только скрывающимися, но и убитыми во время разгула армии. Уже осенью 1944 года были начаты крупномасштабные карательные акции, из которых, вероятно, самая крупная была проведена в сельских округах Камаяй и Обеляй в Рокишкисском районе 20-25 ноября 1944 года. В ходе семи операций было убито 68 человек, 244 арестовано, при этом было изъято только три автомата, два пистолета-пулемета, семь винтовок, два пистолета-пулеметчика и 17 гранат. Таким образом, большинство убитых, задержанных и арестованных лиц были безоружны.