В своих стратегических военных планах кремлевское руководство оценивало Литву не только с экономической, но и с геополитической и военной точек зрения. Самый быстрый способ добраться до Западной Европы пролегал через Литву и Калининградскую область, кроме того, незамерзающие порты Клайпеда и Калининград также были важны, Москву меньше интересовало направление Скандинавии. Поскольку средства, вложенные в экономическую инфраструктуру Литвы, были связаны с военными целями, руководство СССР само было заинтересовано в развитии экономики Литвы. В АдминистрацияLSSR должна была рационально использовать предоставленные ей ресурсы, и она справилась с этой задачей. Вынужденный рост советской промышленности сделал Литву зависимой от инвестиций Советского Союза, особенно в сырье. Это полностью соответствовало военным и другим интересам Москвы, но не реальным потребностям литовского населения.
Производительные силы развивались и развертывались с учетом государственных интересов СССР. Быстрый промышленный рост был достигнут в основном за счет развития производства средств производства (например, производство машин за семь лет увеличилось в 4,4 раза). Однако индустрия потребительских товаров не удовлетворяла потребности населения ни по количеству, ни по качеству, ни по ассортименту. Многие товары легкой и пищевой промышленности были отправлены в СССР: в 1965 году продукция легкой промышленности (трикотаж, обувь, текстиль и т.д.) составляла 27,6% от общего объема производства. Крупнейшие города СССР, включая Москву и Ленинград, были основными потребителями продуктов питания. Средства на потребительские товары распределялись централизованно, и на литовский рынок поступало слишком мало продовольственных и промышленных товаров. ЛССР руководство критиковало эту ситуацию, но в принципе ничего не могло изменить. Тем не менее, в магазинах Литвы, в отличие от городов России, за исключением Москвы и Ленинграда, всегда были основные продукты питания и продукция легкой промышленности. Жители соседней Беларуси приезжали в Вильнюс даже днем, чтобы сделать покупки, а туристы из остальной части СССР забирали или отправляли по почте значительное количество продуктов.
За несколько десятилетий облик Литвы изменился до неузнаваемости. В Литве никогда раньше не было такого промышленного скачка или потрясения промышленности (велось масштабное строительство промышленных, общественных и жилых объектов, был развит мощный энергетический сектор, построены тысячи километров новых дорог и т.д.). Снечкус часто утверждал в Москве, что финансирование Литвы было необходимо по политическим и пропагандистским причинам — Запад должен был видеть разницу между Литвой «времен Сметоны» и «Советской Литвой». С другой стороны, пытаясь добиться различных средств и лимитов в Совете Министров СССР, Шумаускас сказал, что деньги, вложенные в Литву, окупятся быстрее, чем в других республиках. На самом деле, хотя на Литву постоянно оказывалось давление с целью добиться запланированных результатов раньше запланированного срока, обязательства в целом были выполнены.
В 1959 году после политической атаки ЦК КПСС против «прибалтийских региональных узколобых и националистических тенденций» в Москве все громче звучали требования обеспечить требуемый централизм в новых экономических условиях и планирование в национальной экономике, а также необходимость повышения роли политики Государственного планового комитета по всему СССР. Планирование и управление централизованной социалистической экономикой, основанной на государственной собственности и бюрократическом управлении, не дали желаемых результатов. В конце 1950-х — начале 1960-х годов экономическое развитие СССР замедлилось. Чрезмерные советские амбиции в области освоения космоса, гонка вооружений и масштабные инвестиции в новые отрасли промышленности способствовали замедлению экономического роста. Это полностью противоречило публично объявленным планам Хрущева к 1970 году не только догнать, но и превзойти США по общему уровню производства и объему производства на душу населения.
Начали искать причины неудачи и были высказаны сомнения в целесообразности реформ, осуществленных в 1956-1957 годах. Начали заявлять, что в условиях советской экономической системы координировать общее развитие экономики страны было возможно только на основе информации, имеющейся в Москве. Этому препятствовали Народные экономические советы республики, которым были предоставлены многие управленческие функции и большая часть экономической информации. Таким образом, в начале 1960-х годов в СССР стали очевидны признаки централизации экономики.