Главной целью литовского антинацистского сопротивления было устранение нацистской оккупации и восстановление независимого литовского государства. «Движение сопротивления ориентировалось на Соединенные Штаты и Англию, веря в реализацию принципов Атлантической хартии. Коммунистический Советский Союз и нацистская Германия считались злейшими врагами Литвы.
Хотя Германия провозгласила, что она освободила Литву от «большевистского ига», она не была готова признать Временное правительство Литвы и провозглашенное им восстановление литовского государства. Немецкий оккупационный режим пришел на смену советской оккупации и аннексии. 5 августа 1941 года нацистское оккупационное правительство приостановило деятельность Временного правительства и запретило деятельность политических организаций и партий (за исключением Литовской националистической партии, которая действовала до декабря 1941 года). Нацистские захватчики сохранили экономическую систему, введенную Советами в Литве — национализировали промышленность, землю, совхозы, жилые дома и другую частную собственность мучителей — и не признали законы о реприватизации, принятые Временным правительством.
Из-за грубой и простой нацистской политики угнетения, в конце 1941 года, тайна литовский устойчивость организации — Литовского фронта (Lietuviu frontas, ЛФ), Союза литовских борцов за свободу (Летувос Лайсвес kovotoju sajungaбыл, LLKS), литовской освободительной армии (Летувос Лайсвес армия, лла) и другие — начали формироваться. Специфической чертой антинацистского сопротивления в Литве была тактика невооруженного сопротивления. Лидеры литовского антинацистского движения сопротивления поняли, что из-за чрезвычайно жестокого оккупационного режима (массовые убийства и депортации мирных жителей) маленький литовский народ не сможет сопротивляться нацистскому режиму ни долго, ни открыто (с оружием в руках). Действия партизан во время войны вызвали бы массовые репрессии со стороны захватчиков и привели бы к уничтожению нации в неравной борьбе.
Невооруженное сопротивление нацистской оккупации имело место в различных формах: a) отказ от присоединения к организуемым немецким военным частям, b) уклонение от поездок на работу в Германию, c) невыполнение сельскохозяйственных обязательств, d) антинацистская пропаганда и агитация, e) мирная борьба за сохранение литовских культурных и образовательных учреждений, и f) разоблачение и запугивание коллаборационистов.
Литовский фронт и Союз борцов за свободу Литвы были самыми сильными и активными организациями антинацистского сопротивления. LF был популярен в основном среди молодежи и интеллигенции, склоняющейся к христианско-демократическим взглядам, в то время как LLKS — среди тех, кто более склонен к национализму и либерализму. В LF была военная секция (организация под названием Кестутис), а также политико-информационный и финансовый отделы. Начиная с 1943 года ЛФ издавала подпольные газеты «I laisve» («К свободе») и «Lietuviu fronto biuletenis» («Информационный бюллетень Литовского фронта»). Другие группы, связанные с LF, издавали секретные мини-газеты «Vardan tiesos» («Во имя правды»), «Pogrindzio kuntaplis» (сатирические) и «Lietuvos Judas» (газета, разоблачающая коллаборационистов).
Как и LF, LLKS была основана в конце 1941-начале 1942 года. В октябре 1942 года LLKS начали издавать собственную газету «Лайсвес Ковотояс» («Борец за свободу»). До лета 1944 года было опубликовано 28 номеров газеты. В 1943-1944 годах гестапо удалось арестовать нескольких издателей и руководителей LLK. LLKS также опубликовали «Apzvalga» («Обзор»), внутренний информационный бюллетень организации, и «Laisvas zodis» («Свободное слово»). LLKS был разделен на четыре региона: Вильнюс, Каунас, Шяуляй и Паневежис. Районные руководители основали отделения организации во многих сельских округах Литвы. Согласно информации Верховного командования LLKS, в середине 1943 года в организации насчитывалось около 3000 членов. В начале 1944 года LLKS основали секретное радио «Лайсвосиос летувос» («Свободная Литва»). Радиопередачи были услышаны даже в Швеции.