В 1942-1943 годах необходимость объединения сил литовских организаций сопротивления и создания совместного движения сопротивления становилась все более насущной. Однако из-за различий во взглядах и партийных возражений создание единого политического центра заняло некоторое время. До создания Верховного комитета освобождения Литвы (Vyriausiasis Lietuvos islaisvinimo komitetas, VLIK) существовало два политических центра: Национальный совет (Таутос тарыба, TT) и Верховный литовский комитет (Vyriausiasis lietuviu komitetas, VLK). Созданная весной 1942 года, ТТ объединила следующие группы и организации католической ориентации: Литовский фронт, христианских демократов, Федерацию труда, Союз фермеров и Движение за единство Литвы (Летувиу виенибес саюдис, LVS). ВЛК состояла из ЛЛКС, социал-демократов и членов Националистического союза (таутининкай), популистов (ляудининкай), и националистов (бывших членов Литовской националистической партии). После пяти месяцев переговоров между TT и VLK было решено создать единое подпольное руководство — VLIK. Первое заседание VLIK состоялось 25 ноября 1943 года в Каунасе. Социал-демократ Проф. Дж. Степонас Кайрис был избран председателем VLIK и доцентом. Проф. Адольфас Дамушис (LF) и Балыс Гайджюнас (Националистический союз) были избраны заместителями председателя. Таким образом, руководство антинацистского сопротивления было создано демократическим путем и представляло почти все старые партии и вновь созданные организации в их борьбе против захватчиков (за исключением LLA). До восстановления независимости VLIK должен был выполнять роль незаконного литовского правительства, возглавлять сопротивление и защищать суверенные права Литвы в Литве и за рубежом. После создания VLIK, TT и VLK прекратили свою деятельность. 16 февраля 1944 года VLIK опубликовал декларацию «К литовскому народу!», в которой изложил свою программу работы.
Стремясь привлечь внимание западных демократических государств к проблеме свободы Литвы, литовское сопротивление искало поддержки и контактов в Западной Европе. В июле 1943 года Альгирдас Вокиетайтис, член LLKS, переправился через Балтийское море в Швецию. Литовский комитет, основанный в этой стране, раскрывал преступную политику нацистов в Литве в шведской прессе, сообщал о деятельности литовского сопротивления и продвигал идею независимости Литвы.
Степонас Кайрис.
Литовские дипломаты Степонас Гарбачяускас, Альбертас Герутис, Юргис Шаулис и Эдуардас Тураускас занимались политической деятельностью в Швейцарии, они редактировали антигерманские бюллетени Elta и отправляли их за границу, а также поддерживали контакты с представительствами Литвы в США и Англии, с Казисом Шкирпой, работающим в Берлине, и с VLIK. Таким образом западные страны узнали о реальной ситуации в Литве: преступлениях нацистов (истребление евреев, экономический разграбление страны и т.д.), литовском сопротивлении и стремлении к независимости. В марте 1944 г. VLIK направил своего представителя подполковника Казиса Амбразиеюса в Финляндию. Он должен был проинформировать финнов о ситуации в Литве и попросить оружие для будущей борьбы литовской армии за независимость. Амбразиехус должен был отправиться в Хельсинки и связаться с капитаном Генерального штаба Э. Мартиалой, однако 21 апреля 1944 года гестапо арестовало его в Таллине. В апреле-мае 1944 года начались массовые аресты участников сопротивления в Прибалтике.
Предвидя неминуемое вторжение советской Армии, VLIK назначил своих представителей в Германии — прелата Миколаса Крупавичюса, юриста Раполаса Скипитиса и Вацловаса Сидзикаускаса. Три представителя так называемого «малого VLIKА» должны были остаться в Литве (но только один из них [Повилас Шилас] остался). Летом 1944 года деятельность VLIK в Литве прекратилась. После того, как Советы оккупировали Литву, началось антисоветское сопротивление литовцев.