С вопросом о передаче шпионских сведений возникли проблемы. Сначала был один следователь, который одобрил версию о передаче информации через Дюбоне, поскольку не знал, что Дюбоне — торговец винами во Франции. Этот следователь заболел. Пришел другой. Была принята другая версия. Якобы Кондорский сидел в кафе во Франции и рисовал проект новейшего самолета, что было зафиксировано посетителем кафе, оказавшимся сотрудником спецслужбы. Следователь был очень доволен такой версией, посмеялся над Дюбоне, хотя не знал, что новое действующее лицо — Пепсо, был главой мотоциклетной фирмы.
Начальник аэродинамического отдела ЦАГИ АЭ. Стерлин обвинялся в том, что срывал научно-исследовательскую работу в ЦАГИ (см. Док. № 4). Конкретно работы по созданию аэродинамической трубы были спроектированы «вредительски». Имело место отставание от американцев, которые создали ее в 1931 г. Испытания отечественных самолетов в натуральную величину в аэродинамической трубе изначально содержали ошибки в расчетах. Вместо 180 млн рублей было затрачено 500 млн. Кроме того, Стерлин слишком много внимания уделял научно- теоретическим работам в ущерб практике (ЦА ФСБ России. АСД Р-1474).
Начальник бригады по проектированию винтов ЦАГИ B.JI. Александров был арестован 2 февраля 1938 г. по обвинению в том, что якобы тормозил производство металлических винтов.
28 мая 1940 г. на основании записки Л.П. Берии ученые-конструкторы ЦАГИ были приговорены к 10 годам заключения и направлены в специальное техническое бюро НКВД СССР (ЦА ФСБ России. АСД Р-2211).
При том, что главное обвинение, предъявленное функционеру германской секции Коминтерна JL Флигу, заключалось в участии в нелегальной правотроцкистской организации в Коминтерне и шпионской работе на германскую и французскую разведки, большая часть протоколов его допросов (см. также Док. №№ 42, 45) посвящена «разоблачению» деятельности одного из руководителей германской компартии В. Мюнценберга, который в это время проживал во Франции. Самостоятельная линия поведения В. Мюнценберга якобы поддерживалась Г.Е. Зиновьевым, Н.И. Бухариным, В.Г. Кнориным и И.А. Пятницким, способствовавшими расколу внутри Коминтерна. Также они покровительствовали группе Г. Неймана — Г. Реммеле. Мюнценберг обвинялся в связях с германской разведкой, хотя документальные материалы свидетельствовали о том, что он предлагал сотрудничество французским властям для борьбы с фашизмом.
В показаниях Флига отражены и реальные проблемы, с которыми сталкивалось руководство Коминтерна. Мюнценберг критиковал В. Пика и Г. Димитрова за нерешительность в борьбе с фашистским режимом. Не избежали критики и советские руководители. Он отмечал отсутствие свободы слова и дискуссий в СССР, низкопоклонство перед Сталиным, что было невозможным в европейских странах.
Последовавшие далее аресты 22 июня 1937 г. заместителя заведующего отделом пропаганды ЦК ВКП(б) В.Г. Кнорина, бывшего заведующего Среднеевропейским ландерсекретариатом ИККИ, а затем бывшего секретаря ИККИ И.А. Пятницкого привели к эскалации арестов в аппарате Коминтерна (см. Док. № 1).
В результате были репрессированы руководители, отвечавшие за нелегальные каналы связи между компартиями. В отношении Пятницкого, Кнорина, работавших в Коминтерне до 1935 г., и других выдвигались обвинения в том, что они якобы ставили своими задачами: дезорганизацию Коминтерна и постепенное овладение аппаратом Исполкома Коминтерна; объединение троцкистских и других оппозиционных сил внутри компартий с целью парализации их работы; организацию систематических выступлений во всем мире против политики и нелегальной деятельности ИККИ и его партий в капиталистических странах; ведение антисоветской пропаганды; устранение и дискредитацию отдельных руководителей Коминтерна; борьбу за завоевания руководства в отдельных компартиях, за выход этих партий из Коминтерна и вовлечение их в IV Интернационал.
Следователи НКВД выдвинули версию об их связи с сыном Троцкого Седовым, которая осуществлялась через Вилли Мюнценберга, находившегося постоянно в Париже. Приблизительно 10 % всего бюджета, который получал Мюнценберг, якобы передавались Седову. Таким образом, троцкисты финансировались из кассы ИККИ, а также «получали» документы и информацию о положении в международном коммунистическом движении и важнейшие решения исполкома Коминтерна.
В результате активной деятельности следователей НКВД в ИККИ была сформирована «контрреволюционная правотроцкистская организация», где ведущую роль играли ряд его руководителей.