Ход исторических событий — периодизация басмаческого движения — напрямую отразились на составе документов. Так, 1920–1922 гг. это время наиболее мощного и организованного движения басмачей. В этот период басмачество возглавляли наиболее крупные и известные руководители движения: Иргаш, Мадамин-бек, Курширмат, Муэтдин-бек, Джунаид-хан, Ибрагим-бек и др. Кроме того, в Туркестане действовали и политические вожди движения — М. Чокаев, З. Валиди, Т. Джанузаков, а также турецкие деятели во главе с Энвер-пашой. В это время наиболее драматичные события происходили в Ферганской долине, Бухаре и Хиве. Однако к концу 1922 г. основные силы басмачей были разгромлены Красной армией, большинство крупных курбаши были пленены или убиты, оставшиеся в живых политические лидеры басмачества эмигрировали. Последними оплотами басмачей оставались в это время горные районы Восточной Бухары и пески Каракумов. С переходом из Восточной Бухары в Афганистан в 1926 г. Ибрагим-бека басмачество как военно-политический фактор на территории советского Туркестана перестало существовать. Главные его силы сосредоточились в Афганистане (эмигранты во главе с эмиром бухарским) и Иране (Джунаид-хан), откуда время от времени мелкие отряды басмачей совершали набеги на советские республики Средней Азии. В документах ОГПУ за 1926–1928 гг., отложившихся в фондах ЦА ФСБ России, информация о басмачах сходит на нет. В редких случаях речь может идти о мелких бандах грабителей, проникающих из-за рубежа, а также информация об антисоветской деятельности эмигрантов.
Положение резко изменилось в 1929 г. С одной стороны, в результате проведения политики коллективизации обострились отношения советской власти с населением, а с другой — свержение Амануллы-хана в Афганистане и последовавшая затем гражданская война способствовали активизации басмачей. Однако новое вторжение Ибрагим-бека на территорию Советского Таджикистана закончилось для него разгромом и пленением, причем в захвате Ибрагим-бека активное участие приняли местные жители, что свидетельствовало об окончательной потере басмачеством имиджа национально-освободительной борьбы. В дальнейшем басмачи ассоциировались только с мелкими бандами грабителей и убийц, проникавших из-за границы. Единственным крупным курбаши, оставшимся в живых и умершим своей смертью, был Джунаид-хан, нашедший себе пристанище в Иране.
События 1929–1931 гг. подробно отражены в документах ОГПУ. При этом они свидетельствуют, что немаловажным, если не решающим фактором окончательного разгрома басмачей, стали события в Афганистане, в ходе которых Ибрагим-бек и его сторонники были вытеснены из страны пришедшим к власти Надир-ханом.
Возникновение и развитие басмачества в Центральной Азии обуславливалось рядом причин: экономическими — развал хозяйства и обнищание населения; политическими — сопротивление значительной части населения советской власти, попытки местных национальных элит оторвать Туркестан от России и образовать независимое исламское государство; культурными и религиозными — культурная отсталость и неграмотность коренного населения, религиозные предрассудки и фанатизм; наконец, активной поддержкой басмачей иностранными государствами. Кроме того, немаловажное значение имели недостатки и просчеты, допускавшиеся коммунистами и советскими работниками в своей деятельности и отношениях с населением.
Одной из особенностей рассматриваемых документов, как уже было отмечено, является их информационный характер. Причем, как правило, это информация негативного характера, что было обусловлено целями и задачами органов безопасности. В задачи чекистов на местах входили не только организация оперативной деятельности и борьба с врагами советского государства, но также информирование своего руководства в Центре о тех проблемах и недостатках, которые, по их мнению, мешали борьбе с басмачами и представляли угрозу советской власти в регионе. Среди основных проблем, которые освещаются в донесениях органов ВЧК — ГПУ, поступавших в Центр из Туркестана в 1920‑е гг., выделяются следующие:
— плохая работа местных советских и партийных органов из-за засоренности их антисоветским, корыстным и националистическим элементом; оторванность местного населения от советской власти, которую оно не считает своей;
— противодействие местных советских властей работе органов ЧК, попытки подчинить их своему влиянию, тяжелые условия работы и проживания, недостаточное финансирование, нехватка кадров, плохо охраняемая граница;
— низкая эффективность ведения боевых действий Красной армией, вытекающая из недостаточного учета местных условий, а также плохого снабжения и неудовлетворительных бытовых условий.
Именно обилие негативных фактов, в том числе о деятельности советских органов на местах, о недостойном поведении многих ответственных работников государственного и партийного аппаратов, были в свое время одной из причин засекречивания рассматриваемых документов.