Из бюджета императрицы выделялись крупные суммы. Исследователь Ульянова приводит цифры, свидетельствующие о той большой помощи, которая оказывалась из бюджета императрицы Марии Федоровны различным общинам сестер милосердия, в том числе Общине сестер милосердия Святого Георгия (с 1871 года), Больнице Святой Ольги (с 1882 года), Мариинскому родовспомогательному дому (с 1886 года), Общине сестер милосердия Святой Евгении (с 1900 года), больнице Михайловского общества в память Скобелева (с 1917 года), Гатчинской лечебнице (с 1896 года), Минскому городскому родильному приюту (с 1898 года). С 1908 года оплачивалось жалованье персоналу светолечебного кабинета при Военно-медицинской академии.
Также на благотворительные пожертвования, распорядительницей которых была императрица, содержались больные в светолечебнице клиники медицинского факультета Казанского университета, на пожертвования дам из высшего петербургского общества в память 25-летия бракосочетания Марии Федоровны и Александра Александровича выпускницы институтов благородных девиц «по выходе замуж» получали специальные пособия. Но капитал в 71 тысячу рублей, направленный дарителями императрице, она использовала для выплаты пособий «на воспитание детей вдов убитых в войну с Турцией 1877–1878 годов офицеров Рущикского отряда».
Помощь детям и детским учреждениям была приоритетным направлением. В конце 1880 года Ведомство учреждений императрицы Марии курировало работу 129 детских приютов на всей территории России.
Царская чета всегда старалась лично помочь всем, кто нуждался, особенно если это касалось детей. В литературе сохранилось множество рассказов о трогательных историях, свидетельствовавших о высокосердечной доброте Марии Федоровны и Александра Александровича. Царственные супруги всегда согласовывали свои поступки с основными заповедями православной религии, стараясь помочь ближнему.
Художник А. Боголюбов рассказывал: «Однажды я прошел к Государыне Цесаревне под влиянием грустного события, происшедшего в академическом подвале подо мною с одним из бедняков, служителем. Сестра его жены, вдова, жившая поденною работой и имевшая двух малолетних детей, внезапно умерла, оставив своих сирот человеку, обремененному своей семьей и не имевшему никаких средств к их содержанию…»
Мария Федоровна, выслушав рассказ, тут же сказала: «Ступайте к Федору Адольфовичу Оому (секретарь императрицы. —
Другая история касалась дочери небогатой классной дамы Смольного института Оли Ульяновой, с раннего детства прикованной к постели. Узнав об этом, Александр Александрович распорядился выделить на ее лечение и содержание крупную сумму денег.
Императрица ежегодно жертвовала 300 рублей из личных средств на содержание детской заразной больницы Старого Петергофа. 600 рублей поступало по распоряжению Александра III из Министерства императорского двора.
В знак признания больших заслуг императрицы-матери в деле развития благотворительности в России император Николай II на Пасху 1898 года преподнес Марии Федоровне удивительный пасхальный подарок — драгоценное яйцо работы фирмы «Фаберже», выполненное на сюжет важного для вдовствующей императрицы события — столетнего юбилея Ведомства учреждений императрицы Марии. Яйцо называлось «Пеликан». Птица, разорвавшая себе грудь, чтобы напоить своей кровью птенцов, — древний символ самопожертвования, — была избрана эмблемой благотворительных учреждений Ведомства Императрицы Марии.
Внутри золотого яйца-складня с пеликаном находился «сюрприз» в виде ряда миниатюр с изображениями различных женских благотворительных институтов и воспитательных домов, среди которых были: Смольный институт благородных девиц, Екатерининский институт, Сиротский институт Императора Николая I, Ксенинский институт и др. В деятельности всех вышеперечисленных институтов Мария Федоровна принимала самое активное участие, направляла из личных средств большие суммы денег.
Большую работу проводила Мария Федоровна как глава Российского общества Красного Креста. 24 апреля 1878 года указом императора Александра II она была награждена знаком отличия Красного Креста первой степени за попечение о раненых и больных воинах в период Русско-турецкой войны. В 1900 году ей был вручен диплом Международной выставки Красного Креста в Париже. В годы Русско-японской войны 1904–1905 годов и Первой мировой войны императрица также стояла во главе Российского общества Красного Креста.
Общество было создано на основе «Общества попечения о раненых и больных воинах» в 1867 году стараниями императрицы Марии Александровны. «Содействие во время войны военной администрации в уходе за ранеными и больными воинами и оказание им как врачебного, так и всякого рода вспомоществования» — так говорилось в уставе общества.