В 1991 году Советский Союз прекратил свое существование. На карте появилось новое государство – Российская Федерация. В соответствии с требованиями закона Советский Фонд Рерихов должен был пройти перерегистрацию. По инициативе Святослава Николаевича он был преобразован в Международный Центр Рерихов (МЦР). Будучи правопреемником СССР, Россия стала отвечать по его обязательствам. В соответствии с законодательством законы и иные нормативные акты СССР продолжали свое действие в РФ. Соответственно, в полном объеме действовало и Постановление 1989 года о создании общественного Центра-Музея имени Н.К.Рериха. Однако чиновники фактически документ саботировали. МЦР было отказано в выделении государственных средств на реставрацию усадьбы Лопухиных, где должен был размещаться новый музей. Министерство культуры РФ продолжало незаконно удерживать 288 рериховских картин из наследия С.Н.Рериха в Государственном музее Востока. На этом фоне со стороны ГМВ была развернута целая кампания по дискредитации руководства МЦР. Цель этих действий состояла в передаче всего принадлежащего С.Н.Рериху наследия в Государственный музей Востока под управление Министерства культуры РФ. Создание общественного музея было поставлено под угрозу.
Обеспокоенный ситуацией Святослав Николаевич в апреле 1992 года обратился с Открытым письмом к рериховским обществам. В письме он ясно обозначил свою волю: «Международный Центр Рерихов, – говорилось в нем, – созданный по моей инициативе и почетным Президентом которого я являюсь, стал той организацией, через которую я могу обращаться и сотрудничать с рериховскими обществами. Подтверждаю полномочия вице-президента и директора Музея им. Н.К.Рериха Людмилы Васильевны Шапошниковой. Прошу во всех необходимых случаях советоваться с ней. Меня беспокоят попытки некоторых лиц, без всяких на то оснований, подвергнуть сомнению ее деятельность и тем самым выразить недоверие к моему решению»[26].
Одновременно Святослав Николаевич написал письмо президенту РФ Б.Н.Ельцину. «Глубокоуважаемый Борис Николаевич. Обстоятельства заставляют еще раз обратиться к Вам в надежде встретить, как всегда, Ваше понимание. ‹…› В это тяжелое для моей Родины время Центр столкнулся с трудностями, мешающими его широкой культурной деятельности, которую он активно ведет вот уже два года, используя наследие моих родителей, переданное ему мною в 1990 году. ‹…› Хорошо понимая нелегкое положение дел в России, я тем не менее надеюсь на финансовую поддержку Центра со стороны Российского Правительства. ‹…› Кроме этого я хотел бы обратить Ваше внимание на одно обстоятельство. В 1990 г. я вместе с остальным наследием передал Центру большую выставку картин моего отца и моих ‹…›, которая долгое время находилась в ведении Министерства культуры СССР. Теперь эту выставку незаконно удерживает Музей искусства народов Востока. Очень прошу Вас содействовать передаче ее Международному Центру Рерихов»[27].
Осенью 1992 года Святослав Николаевич оформляет у нотариуса в Индии дополнение к своему завещанию. Новым документом он подтверждал правопреемство Международного Центра Рерихов на переданное ранее Советскому Фонду Рерихов наследие.
30 января 1993 года Святослав Николаевич умер в Индии. Это произошло за две недели до открытия первой экспозиции общественного музея во флигеле реставрируемой на народные средства усадьбы Лопухиных. Смерть С.Н.Рериха развязала руки руководству Министерства культуры РФ и Государственного музея Востока для открытых действий по уничтожению общественного музея и захвату его основы – наследия Рерихов.
Уже через 20 дней после похорон С.Н.Рериха принадлежащие ему 288 картин в нарушение всех норм закона переводятся приказом директора ГМВ на постоянное хранение. Министерство культуры предпочитает не замечать произвола. В ноябре 1993 года музей Востока при поддержке все того же Минкульта добился выхода правительственного Постановления за подписью премьер-министра В.С.Черномырдина «О создании государственного музея имени Н.К.Рериха». Постановление было основано на фальшивых документах, сфабрикованных экс-секретарем С.Н.Рериха. Согласно Постановлению, в усадьбе Лопухиных спешно создавался государственный музей на правах филиала Государственного музея Востока. Его основу должны были составить фонды, отбираемые у общественного музея Международного Центра Рерихов. Чиновники поступали в привычной для себя манере нравственной глухоты, по-хозяйски распоряжаясь чужой собственностью. Их ничуть не смущало, что новое Постановление противоречило воле и завещанию С.Н.Рериха и вело к разрушению общественного музея, созданного в соответствии с уже действующим несколько лет правительственным Постановлением 1989 года. Все делалось в формате блицкрига. На осуществление захвата усадьбы Лопухиных тут же нашлись государственные средства. Министерство культуры и другие министерства выделяли лимиты «государственных капитальных вложений и бюджетных ассигнований на проектирование, реконструкцию и реставрацию Усадьбы Лопухиных»[28].