Принц пытался уговорить жену переехать во Флоренцию, но она и слышать об этом не желала. Анна Мария Франциска вбила себе в голову, что все Медичи травят своих жен. Единственным утешением Жана Гастона в этот период был его близкий человек, слуга и любовник Джулиано Дами. Вскоре принц пристрастился к вину и азартным играм, в результате чего проигрывал крупные суммы денег. Он тайком начал ездить в столицу Богемии Прагу, переодевшись простым горожанином, и посещать местные злачные места. Чтобы покрыть свои карточные долги, Жан Гастон тайком брал из шкатулки жены драгоценности, которые она никогда не носила, и закладывал их в ломбардах Праги. Принц проводил много времени в кабаках с местными лакеями и бродягами, напивался вдрызг, научился скандалить и дебоширить. Потом он начал курить табак и жевать под выпивку хлеб с перцем и семенами тмина, как это было принято у немцев. Ссоры между мужем и женой становились все более частыми, и это делало их сосуществование совершенно невыносимым. Тогда Жан Гастон решил совершить путешествие по Европе под вымышленным именем маркиза Сиенского.
В 1698 году принц отправился во Фландрию, Германию и Францию. В Париже он удостоился чести быть принятым королем Людовиком XIV, который был поражен неординарной личностью, образованностью и манерами своего двоюродного племянника. Но главной целью принца было встретиться со своей матерью Маргаритой Луизой Орлеанской, которая тогда жила в монастыре Сен-Манде. Он решил сделать маме сюрприз и не предупредил заранее о своем приезде. Жан Гастон просто пришел в монастырь и попросил одну из сестер объявить Маргарите Луизе о своем визите. Ответ был коротким и холодным – эгоистичная герцогиня не желала видеть младшего сына. Только под давлением короля Людовика XIV она согласилась на очень короткую и формальную встречу. Французские придворные отнеслись немного с презрением к итальянскому родственнику своего монарха, но при этом осуждали Маргариту Луизу за такое отношение к собственному сыну. Это нанесло еще одну глубокую душевную рану 27-летнему принцу, и он покинул Францию разочарованный.
Когда Козимо III узнал о путешествии Жана Гастона, не получившего на это отцовского разрешения, он пришел в ярость и заставил сына вернуться в Рейхштадт. Принцу пришлось подчиниться воле отца, и он без особой радости вернулся к жене. Но ситуация не наладилась, а наоборот, все больше накалялась. Жан Гастон все чаще уезжал в Прагу, где продолжал предаваться самым гнусным утехам в публичных домах и кабаках, напиваться, сквернословить и дебоширить. В этих поездках его неизменно сопровождал Джулиано Дами, который делал все, чтобы удовлетворить желание своего хозяина. Несмотря на неудачу в браке, Козимо III настаивал на том, чтобы его сын выполнял свои супружеские обязанности с женой. Он уже потерял надежду дождаться внука от больного сифилисом принца Фердинанда и сделал попытку уговорить Анну Марию Франциску переехать вместе с его сыном во Флоренцию.
Возвращение Жана Гастона во Флоренцию
Сначала принц приехал во Флоренцию в 1705 году один, в надежде, что его жена приедет вслед за ним. Но этого не произошло, Анна Мария Франциска не собиралась покидать свою деревню и замок, и Жан Гастон вернулся в Богемию. Он продержался там долгих три года, которые казались бесконечностью. Наконец Жан Гастон не выдержал и в 1708 году вернулся в Тоскану окончательно – один, без жены, которая еще раз наотрез отказалась переезжать. Козимо даже старался оказать давление на невестку через архиепископа Праги Иоганна Йозефа фон Брейнера, своих родственников и через самого папу Климента XI, который призвал Анну Марию Франциску присоединиться к своему мужу во Флоренции. Принцесса пришла в ярость и, ругаясь последними словами, заявила архиепископу Брайнеру, что ее муж – полный импотент, и что нет никакого смысла им больше жить вместе. Больше Жан Гастон никогда не видел жену, чему был несказанно рад. Они не развелись и не аннулировали брак, для них это не играло никакой роли. Принц только хотел, чтобы его оставили в покое и не заставляли жениться снова, а его жену устраивала перспектива не выходить больше никогда ни за кого замуж.
Анна Мария Франциска после смерти Козимо III Медичи стала великой герцогиней Тосканы, но, несмотря на это, продолжала проживать в Рейхштадте. Она пережила мужа на четыре года, успела выдать замуж дочь и увидеть внуков. Великая герцогиня Тосканы Анна Мария Франциска умерла в 1741 году в возрасте 69 лет и была похоронена рядом со своим первым мужем в приходской церкви Рейхштадта.