Джованни Медичи родился 11 декабря 1475 года, он был четвертым ребенком и вторым сыном Лоренцо Великолепного и Клариче Орсини. Про него Лоренцо говорил: «Мой второй сын умен». Действительно, он сильно отличался от своего старшего брата – глупого, надменного и распутного красавчика Пьеро Невезучего. Все сыновья Лоренцо Медичи получили прекрасное образование, им повезло, что их учителями были Аньоло Полициано, Джованни Пико делла Мирандола и Марсилио Фичино. Во дворце Медичи жил и учился вместе с ними их двоюродный брат Джулио, который с детства был привязан к Джованни. Они были практически неразлучны, несмотря на то что Джованни был на три года старше. Впоследствии и Джованни, и Джулио продолжили учебу в Пизанском университете, где изучали богословие и каноническое право. Лоренцо Великолепный готовил их обоих к духовной карьере и старался сделать все, чтобы они получили разностороннее образование. В семье Медичи внебрачные потомки чаще всего становились священнослужителями, вспомните Карло Медичи, незаконнорожденного сына Козимо Старшего. Второго по старшинству сына тоже часто старались направить на путь служения церкви, например, Лоренцо Великолепный пытался добиться сана кардинала для своего брата Джулиано. Но папа Сикст IV его просьбу отклонил, он не мог простить ему отказ в кредите на покупку Имолы. К тому же у понтифика были свои племянники, которым нужна была кардинальская шапка.
Джованни в возрасте семи лет совершил постриг и был назначен апостольским протонотарием, в восемь лет он получил сан аббата в городке Монтекассино. Лоренцо Великолепный долго вел переговоры о его возведении в кардиналы с папой Иннокентием VIII. Главной проблемой было то, что мальчик был несовершеннолетний, нельзя стать кардиналом в 13 лет. Сколько денег пришлось потратить Лоренцо, чтобы ублажить папу: он приказал своим людям разузнать все привычки и пристрастия понтифика, в Рим везли от его имени дорогие ткани, изящные ювелирные изделия, лучшее тосканское вино и оливковое масло, жирных каплунов и фазанов из охотничьих угодий, угрей, выловленных в Арно, и прочие яства. Лоренцо своего добился: его средний сын получил кардинальский сан в возрасте 13 лет. Но, напомню, с условием: официально он становится кардиналом через три года, когда ему исполнится 16. Если кто-то из них двоих, папа или Лоренцо, умрет раньше – сделка недействительна. Удача сопутствовала Джованни, 11 декабря 1491 года он становится официально кардиналом и отправляется в Рим. Через 4 месяца после этого скончался его отец Лоренцо, а следом за ним – Иннокентий VIII.
Внешность у Джованни была неказистая: на фреске Гирландайо в капелле Сассетти мы видим полного ребенка с простодушным лицом, белокурыми волосами, маленькими глазами и слегка вздернутым носом. Мальчик был с детства склонен к полноте и отличался отменным аппетитом, был близоруким с рождения и постоянно щурился. С годами его внешность не улучшилась, но характер у него был спокойный и добродушный, в отличие от заносчивого старшего брата. Когда в их дворце поселился Микеланджело – Джованни относился к нему очень дружелюбно. Они были одногодки, и у них были такие общие интересы, как любовь к искусству. Но большими друзьями Джованни и Микеланджело не стали – за этим ревниво следил кузен Джулио. Как и отец, Джованни рано проявил интерес к искусству и философии, особенно ему нравились древние манускрипты римских и греческих писателей: Вергилия, Плиния, Платона, Аристотеля, Лукреция, Овидия, Гомера, а также средневековых тосканских поэтов: Данте, Петрарки, Боккаччо. Манускрипты были первое, что он пытался спасти и вывезти из дворца Медичи во время его разграбления в 1494 году. Кроме того, Джованни очень нравилась охота. Он часто приглашал в свою компанию Микеланджело, но юный гений был увлечен только скульптурой и все приглашения отклонял. За это его не раз укоряла Контессина, которая говорила: «Ты уже сделал своим врагом Пьеро, не делай же и Джованни». Дело в том, что когда Микеланджело жил в их дворце, Пьеро как-то раз вызвал его и заказал изваять бюсты – свой и супруги Альфонсины Орсини. Но Микеланджело не интересовали портреты, он и впоследствии не принимал такие заказы, и отказал Пьеро. Тот счел мальчика слишком наглым: как это возможно – отказать Медичи. Потом Пьеро делал вид, что не замечает Микеланджело, как будто тот не жил во дворце.
Когда Джованни узнал о смерти отца в апреле 1492 года, он сразу же приехал из Рима во Флоренцию, чтобы оказать поддержку старшему брату. Но вскоре ему пришлось возвращаться в Рим на конклав после смерти Иннокентия VIII. Кандидатов в папы было немного: испанец Родриго Борджиа и кардинал Джулиано делла Ровере. Джованни слишком откровенно выступал против кандидатуры Борджиа и был на стороне делла Ровере. Когда папой избрали Родриго – Джованни снова покинул Рим и вернулся во Флоренцию, где оставался до второго изгнания Медичи.