В 14 ч 40 мин 29 января крейсер вышел из Порт- Артура и на переходе морем никаких миноносцев противника не обнаружил. Тогда он направился к острову Зюйд-Саншантау с целью осмотреть этот район. В 16 ч 08 мин, находясь в 1,5-2 милях южнее этого острова произошел подрыв на мине с левого борта в районе кочегарок. При взрыве погибло 9 кочегаров, корабль получил крен 15“ на левый борт и погрузился до иллюминаторов.
В официальной истории написано, что подрыв произошел “на сдрейфовавшей мине заграждения”.’ Возможно также, что это была и сорванная с минрепа плавающая мина. Командир полагал, что корабль находится на минном поле и может свежим ветром и течением быть нанесен на соседнюю мину. В таком случае гибель большинства личного состава была бы неизбежна.
Считая положение корабля безнадежным, капитан 2 ранга В.Ф. Сарычев отменил отданное распоряжение о заводке пластыря и приказал спустить шлюпки К борту крейсера были подозваны миноносцы. Два из четырех миноносцев, на одном из которых был и сам командир крейсера, с большею частью команды и офицеров пошли в Порт-Артур. Другие же два миноносца временно задержались у крейсера. На одном из них была остальная часть команды и офицеров, среди кот орых возникло опасение, что оставленный крейсер может быть захвачен неприятелем.
Поэтому было принято решение взорвать его с того миноносца, который был свободен от команды. Таковым оказался “Сторожевой” под командой капитана 2 ранга Л.П. Киткина.
Миноносец отошел на три кабельтова и сделал выстрел из кормового торпедного аппарата, но произошла осечка. Вследствие сильной качки торпеда выдвинулась вперед, прибор Обри включился, так что из этого аппарата вторичного выстрела сделать было нельзя. Тогда командир, описав циркуляцию, выстрелил из носового аппарата также с трех кабельтов. Торпеда вышла из аппарата и пошла прямо по направлению к цели, но “уже с половины расстояния пузырьки прекратились, и никакого взрыва не последовало”.{41}
Бросив крейсер, миноносцы ушли в Порт-Артур. На следующее утро 30 января на поиски “Боярина” начальником эскадры были направлены миноносцы “Выносливый”, “Грозовой” и пароход Общества ВосточноКитайской железной дороги “Сибиряк” под общим командованием капитана 1 ранга Н.А. Матусевича. При подходе к Талиенвану стали попадаться плавающие мины, которые расстреливались миноносцами.
Крейсер обнаружили стоящим правым бортом на мели у берега. Начали готовиться к спасательным работам, но мешала свежая погода. Ночью “Боярин”, вероятно, сорвало с мели и, подорвавшись снова он наконец затонул в 40 саженях от юго-западного мыса острова Зюйд-Саншантау. 12 февраля Временный военно-морской суд рассмотрел дело командира погибшего крейсера и признал его виновным в преждевременном оставлении корабля.{42}