В ночь на 27 января 1904 г. без объявления войны японские миноносцы атаковали стоявшую на внешнем рейде Порт-Аргура русскую эскадру. Эскадренные броненосцы “Ретвизан”, “Цесаревич”, крейсер “Паллада” получили торпедные попадания и надолго вышли из строя. Японский флот, имея шесть броненосцев и шесть броненосных крейсеров против оставшихся в строю пяти русских броненосцев и одного броненосного крейсера, блокировал Порт-артурскую эскадру, чем обеспечил высадку в Корее японских войск.
Во время атаки японских миноносцев в ночь на 27 января “Енисей” находился в гавани, “Амур” же, как дежурный корабль вместе с эскадрой — на внешнем рейде Порт-Артура. Вражеские торпеды его миновали, и утром он вошел в Восточный бассейн; во время дневного боя в него попал 305-мм снаряд, который снес трубу кочегарного вентилятора, пробил правый дымовой кожух и застрял, не разорвавшись. Матросы- добровольцы под руководством мичмана Б.В. Давыдова удалили с корабля неразорвавшийся снаряд.
Утром 27 января наместник вице-адмирал Е.И. Алексеев{33}
приказал командиру минного транспорта “Енисей” следовать в Талиенванский залив и поставить поперек входа две линии мин. Одну от материка до острова Норд-Саншантау, другую от Зюйд- Саншантау до острова Паньтау, оставив средний проход в порт Дальний свободным. После окончания постановки командиру предписывалось следовать в Дальний, где предупредить портовые власти о минном заграждении и организовать лоцманскую проводку нейтральных судов. Сам “Енисей” должен был оставаться в Дальнем, “приняв все меры предосторожности”.Минный транспорт “Енисей” во время ночной атаки миноносцев находился на бочке на внутреннем рейде. Еще до получения приказа наместника командир капитан 2 ранга В.А. Степанов отдал команду начать приготовление мин без вставления запалов.{34}
Из погребов были подняты первые сто мин, подвешены к рельсам и половина была приготовлена к постановке. Команда начала обедать, мины, подвешенные к рельсам, охранялись дневальными. В это время к Порт-Артуру подошли главные силы японского флота и открыли огонь по городу и порту. В случае попадания снаряда и детонации находившихся на палубе ста мин от взрыва бы пострадали соседние корабли. Так как времени на спуск мин обратно в трюм нс было, Степанов приказал вынуть запальные стаканы. На всякий случай приспустили шлюпки, хотя в случае взрыва это было бы бесполезно. Встретив отпор береговых батарей крепости и кораблей русской эскадры, японцы прекратили обстрел и скрылись за горизонтом.Вскоре капитан 2 ранга В.А. Степанов получил письменный приказ и план минного заграждения и стал готовиться к походу. Около 17 ч “Енисей” снялся с бочки и вышел в море. На корабле снова начали приготовление мин. Но тут в штабе эскадры спохватились, что транспорт следует один без охранения. Командир получил телеграмму вернуться. Приготовление мин опять приостановили. По возвращении на рейд Степанов получил приказание следовать по назначению в сопровождении крейсера “Боярин”. В очередной раз продолжили приготовление мин. Эта работа осложнялась тем, что часть команды находилась в соответствии с расписанием по боевой тревоге.
Крейсер “Боярин” довел минный транспорт до Талиенвана и ушел обратно в Порт-Артур. Заградитель с полным запасом мин был оставлен без охраны и средств обеспечения в опасном районе.
В ночь на 28 января “Енисей” выставил заграждение в северном проходе из 100 мин из расчета 40 мин на милю. Скорость постановки составляла 5 узлов, временной минный интервал - 18 секунд. Ночью подойти к острову Норд-Саншантау было опасно, поэтому у берега остался проход шириной в 5 кабельтов, который предстояло заградить позже. Ночью “Енисей” стоял на якоре у острова Хенд.
Утром 28 января на “Енисее” начали приготовление следующих 108 мин. По готовности транспорт снялся с якоря и продолжил постановку. После окончания снаряженных мин из трюмов подняли следующую партию в 112 мин и начали их окончательное приготовление. К 19 ч работа была закончена. Поперек Талиенванского залива было выставлено 320 мин на протяжении 7 миль. В связи с неблагоприятной погодой и плохой видимостью береговых ориентиров точность постановки была невысокой. Минный интервал составлял 45,7 м.{35}