На юге же страны только кавказский рубеж был достаточно мощным, а вот район Средней Азии прикрывался хуже. Это и понятно. Долгое время здесь почти не случалось эксцессов, т. к. Иран и Пакистан не имели достаточно мощной авиации, а Афганистан относился к числу друзей. Но положение быстро менялось: американцы, наладив отношения с иранским руководством, получили возможность использовать территорию этой страны для базирования своей разведывательной авиации. Да и сами иранцы не сидели сложа руки и с помощью США быстро привели свою авиацию в соответствие современным требованиям, чему немало способствовал экспорт нефти. Таким образом у южных границ довольно быстро возникла мощная авиационная группировка, которая грозила весьма ощутимо беспокоить советскую ПВО.
Все это не прошло незамеченным со стороны СССР. В 1960-61 гг. дислоцирующийся в Туркменистане отдельный корпус ПВО и 73-я Воздушная Армия были дополнены личным составом и получили новую технику – более 100 ЗРК «Десна» С-75, значительное количество новых РЛС, в том числе 12 станций П-14. В дополнение к двум имевшимся в корпусе авиаполкам перехватчиков прибыло еще четыре. Так был создан 30-й отдельный корпус ПВО. В мае 1963 г. соединение было развернуто в 12-ю отдельную армию ПВО. В состав ее входила 17-я ИАД в составе трех авиаполков, вооруженных истребителями-перехватчиками типов МиГ-17, МиГ-19, Як-25, Як-28П и Су-9. Уже летом произошло боевое крещение нового объединения. Во время пребывания руководства страны во -главе с Л. И. Брежневым в Иране, где они находились с дружественной миссией, двухмоторный поршневой самолет Aircommander-560 нанес «ответный визит» в воздушное пространство СССР. На его перехват командиром 17-й ИАД ПВО полковником А. Д. Котовым были подняты два МиГ-17П 156-го ИАП, базировавшегося на аэродроме Мары-2. Самолеты пилотировали командир звена к-н Степанов и ст. л-т Судариков. Летчики попытались посадить «иранца», но тот, развернувшись, упорно прорывался к границе. Пришлось открыть огонь. Капитану Степанову удалось подбить нарушителя, и тот, хоть и перетянул к себе, упал горящим в километре по ту сторону границы, в 30 км от г. Моминабад. Как потом было установлено, в самолете находились офицер разведки Ирана и полковник армии США. Ровно через год, летом 1964 г., еще один самолет того же типа пересек границу СССР в районе Серехса. На его «встречу» вылетело звено истребителей 156-го ИАП капитана Печенкина. Они перехватили нарушителя и заставили совершить посадку на один из запасных аэродромов в р-не Мары. Экипаж самолета после разбирательства был передан иранской стороне.