Так говорит легенда. На деле же Йорг фон Хальспах высказывался за сравнительно экономичный проект без особых излишеств. Он был специалистом по строительству из кирпича, что также сыграло свою роль, ведь поблизости от Мюнхена не было каменоломен. Кирпичное строительство было более технологичным и стоило дешевле. Архитектор умер в год окончания строительства, едва успев завершить главное дело своей жизни. Его могила находится под северной башней Фрауэнкирхе. При его жизни башни собора не были завершены куполами, однако мастер оставил эскизы, которые были воплощены в жизнь почти через 40 лет.
Свои характерные купола башни церкви обрели только в 1525 году. Их круглая форма имеет собственное наименование «вельшские купола» и получила позднее распространение в южной Германии и Австрии. Считается, что их очертания, необычные для архитектуры поздней готики, соответствуют форме Купола Скалы на Храмовой горе в Иерусалиме и указывают верующим на силуэты Небесного града, Нового Иерусалима.
Мощная стропильная конструкция крыши Фрауэнкирхе возводилась под руководством мастера Хайнриха из Штраубинга. Всего на эту работу ушло около 650 кубометров круглого леса и два года времени.
В 1599-1604 годах в центральном нефе у хоров (алтарной части) церкви была возведена триумфальная арка «Беннобоген», или арка Бенно — как свидетельство успехов борьбы мюнхенских герцогов против Реформации, богато украшенная барочной лепниной мастера Ханса Крумпера. Бенно — имя святого, чьи мощи были перенесены во Фрауэнкирхе из Мейсена для спасения от протестантов.
Обычному в то время стилю барокко соответствовало и оформление главного алтаря с картиной «Возненесение Девы Марии» работы Петера Кандида (1620 год).
В 1821 году, когда Фрауэнкирхе стала епископским собором, потребовалась реконструкция внутреннего оформления. В XIX веке барокко и ренессанс в Германии считались подходящими для светской архитектуры, а готика — для церковной. В ходе соответствующей реконструкции, которая длилась до 30-х годов XX века, арку Бенно убрали, элементы главного алтаря перенесли в боковые капеллы, стены окрасили в одноцветный тон. Гробница герцога Людвига IV Баварского — еще одна достопримечательность Фрауэнкирхе — была перенесена из алтарной части ближе к входу. Могилу покрывает балдахин из черного мрамора. Памятник является кенотафом — пустой гробницей. В пределах Фрауэнкирхе он перемещался четыре раза, а на нынешнем месте стоит с 1962 года. Император и немецкий король Людвиг IV похоронил свою супругу в церкви-предшественнице Фрауэнкирхе, а в 1347 году упокоился и сам рядом с ней. Их останки были перенесены в новую церковь и погребены в склепе в алтарной части. Кенотаф в стиле поздней готики создал Ханс Крумпер в 1620 году. Монумент увенчан подушкой с императорской короной. По разные стороны от нее — дух доброго правления в мирное время со скипетром и лавровым венком и дух правильного правления в военную пору с мечом. У подножия стоят фигуры баварских герцогов Вильгельма IV и Альбрехта V с мечом. Скульптуры воинов со штандартами по углам первоначально предназначались для захоронения герцога Вильгельма V в Михаэльскирхе Мюнхена.
Происхождение капелл по стенам боковых нефов объясняется стремлением прихожан быть погребенным ближе к намоленным местам. В Средние века рядом с любой церковью располагалось и кладбище. Состоятельные горожане-жертвователи определенной суммы храму могли расчитывать на захоронение в церкви, а особенно щедрые семьи обзаводились собственными капеллами-усыпальницами.
У клиросных рядов стоят бюсты апостолов и пророков работы Эразма Трассера (1502 год). Лестницы за церковным хором ведут вниз к княжескому и епископскому склепу, где погребены многие представители династии Виттельсбахов и епископы Мюнхена и Фрейзинга.
Напротив входного портала Фрауэнкирхе в 1972 году скульптором Йозефом Хензельманном был построен фонтан «Беннобрюннляйн», посвященный святому Бенно.
Святого Бенно Мейсенского часто изображают с рыбой в руках, он считается покровителем рыбаков и ткачей. Между жабрами рыбы можно увидеть ключи. Этот святой прожил весьма долгую для Средневековья жизнь и умер своей смертью. Жизнь эта была довольно бурной — в основном благодаря таланту Бенно ссориться с сильными мира сего. Скорее всего, он был далек от политики, но жизнь постоянно ставила его перед необходимостью принять ту или иную сторону, а как человек, далекий от мира, мог уследить за чередой претендентов на верховную власть? Саксонию и Баварию раздирали междоусобицы, вокруг ватиканского престола тоже было неспокойно, и неуживчивый Бенно то и дело попадал в неприятности.