Ливанский орден начал завоевание земель литовцев, куршей, пруссов. 13 июля 1260 года у озера Дурбе литовские войска князя Миндовга разгромили войско Ливонского ордена. В бою погибли великий магистр, орденский маршал и сто пятьдесят рыцарей.
18 февраля 1268 года русское войско встретилось под Везенбергом с ливонско-датским войском. В начале битвы русские полки выдержали невыдерживаемый жестокий удар рыцарей, понеся тяжелейшие потери. Ливонцы зашли в тыл русским и центр русских войск во главе с князем Довмонтом Псковским долго бился в полном окружении. Через два часа Довмонт с полками сбил рыцарей с позиции. Ливонцы дрогнули и побежали. Русская конница била и гнала рыцарей почти семь километров. Ливонские рыцари назвали литовского князя Довмонта Псковского, с седла разрубавшего своим двухметровым двадцатикилограммовым мечом закованного в доспехи всадника с конем, героем битвы при Везенберге.
Поражение Ливонского отделения Тевтонского ордена в войнах с русскими и литовцами поставили его в сложное положение. При содействии императора Рудольфа Габсбургского из германских земель в Балтию пошел поток рыцарей. В Балтии были построены мощные замки Эльбинг, Виндава, Мариенбург, Гольдинген, Митава, Мариенвердер. До начала XIV века Ливонский орден был очень тесно связан со своим руководством в Пруссии. К середине XIV века булла римского папы положила конец ленной зависимости Ливонского ордена от балтийских епископов, его территория включала две трети латвийских и эстонских земель.
С 1309 года резиденцией великого магистра Тевтонского ордена стал Мариенбург, который превратился в столицу большого государства. С Тевтонским орденом по могуществу в Восточной Европе не могло сравниться ни одно государство. Орден владел землями от низовьев Вислы до Мазовии и Литвы.
Во главе государства Тевтонского ордена стоял великий магистр, гохмейстер, избираемый пожизненно. Орденский капитул при гохмейстере был совещательным органом. Все земли Тевтонского ордена разделились на области, которыми управляли комтуры. Этими территориями управлял дейтшмейстер, который единственный, кроме великого магистра, мог собрать орденский капитул. Только это общее собрание ордена могло судить и менять гохмейстера, издавать законы. Общий капитул Тевтонского ордена собирался ежегодно.
Великий магистр имел пять помощников. Великий комтур заведовал всеми финансами ордена. Великий маршал командовал войсками. Важную роль играли великие госпитальер, казначей, гардеробмейстер. После смерти или гибели великого магистра гонцы сообщали об этом во все командорства ордена. По два представителя из них прибывали в Мариенбург. Собравшаяся консистория назначала командора-избирателя, который выбирал второго избирателя, затем они вдвоем выбирали третьего. И так далее. Выборщиков должно было быть тринадцать человек: восемь братьев-рыцарей, четыре брата-служителя и священник. Выборщики давали клятву не избирать незаконнорожденного или бывшего преступника. После обсуждения кандидатов выбирали великого магистра. Звонили колокола, в церкви новому гохмейстеру зачитывали его права и обязанности, он получал регалии из рук священника ордена.
Области Тевтонского ордена делились на командорства и округа. В главных замках округов командоры по воскресеньям собирали советы. Во главе Ливонского отделения стоял пожизненно избираемый магистр с резиденцией в Риге или Вендене. Укрепленными ливонскими замками управляли комтуры и фогты, ежегодно отчитываясь перед капитулом. Совет из пяти высших сановников ордена при великом магистре определял внешнюю политику Ливонского ордена. В 1330 году ливонский орден «Dutcher orden to Luffland» стал феодальным сеньором Риги, победив рижского архиепископа в многолетней борьбе. Полноправных братьев-рыцарей было около полутысячи.
У Тевтонского ордена сложился многовековой опыт управления большими территориями. Он имел мощные торговые и дипломатические связи со многими государствами. Рыцари ордена много путешествовали, имели обширные знания об окружающем мире. В эпоху отсутствия средств массовой информации и связи это имело решающее значение для укрепления власти и управления государством. Тевтонский орден создал Пруссию, сильное светское государство, имевшее большой политический вес в Европе. Рыцари не очень уважительно отзывались об обычных монахах, называя их «капюшонниками». «Капюшонник мог бы быть довольно счастлив, если бы брал для питья воду из реки и захотел выращивать овощи. Но аббат бросает блюдо бобов, лишь только завидит рыбу, и бросает рыбу, как только завидит мясо. Его капюшон не поведет его на небо. Разве поможет строгость устава, если душа не чиста».