В XIX – XX вв. на территории обители располагалось одно из древнейших московских кладбищ. Здесь обрели место своего последнего упокоения многие иерархи Церкви, а также такие выдающиеся деятели русской культуры, как славянофилы Ю.Ф. Самарин и А.С. Хомяков, поэт Н. Языков, музыкант Н.Г. Рубинштейн, художник В.Г. Перов, знаменитый писатель Н.В. Гоголь; а также купцы: Захаровы, Куманины, Овчинниковы, Хлебниковы; представители старинных дворянских родов: Волконские, Вяземские, Голицыны, Львовы, Мещерские, Урусовы и другие.
Разрушенный надвратный храм Симеона Столпника
За свою долгую историю монастырь повидал много. После революции 1917 года обитель была оплотом православия и продержалась поразительно долго – вплоть до осени 1930 года.
По иронии судьбы, первый московский монастырь был закрыт самым последним в Москве. Монастырские храмы подверглись опустошению и перестройкам, была разобрана монастырская колокольня. Сокрушительная буря революции подорвала самые основы народной жизни. Государственной религией был объявлен атеизм, началась война против Бога и Церкви.
Храм Воскресения Словущего в Даниловской слободе
31 мая 1931 года в присутствии специальной комиссии были вскрыты захоронения Гоголя, Рубинштейна, Перова, Хомяковых и Языкова. Их прах перенесли на Новодевичье кладбище, а художника Василия Перова перезахоронили на кладбище Донского монастыря. После этого старинный монастырский некрополь с оставшимися могилами был варварски уничтожен, а на его территории устроили детскую колонию НКВД для детей репрессированных лиц и многочисленные склады.
На монастырском дворе установили памятник Ленину, и вместо монахов в стенах древнейшей московской обители поселились «малолетние преступники».
По свидетельству очевидцев, колонистам было очень тесно в бывших иноческих кельях, и порой им приходилось даже обедать прямо на могильных плитах вместо столов. В результате дети часто болели и умирали. Их хоронили здесь же, в обители святого Даниила.
После закрытия монастыря большинство монахов обители были сосланы в лагеря или расстреляны. Оставшаяся на свободе часть братии служила в храме Воскресения Словущего в Даниловской слободе (храм к югу от монастыря), а в 1932 году его закрыли и передали под различные учреждения. Мощи святого князя Даниила бесследно исчезли, и дальнейшая их судьба неизвестна.
В 1937 году правительство приняло решение о повсеместном истреблении архиереев и священнослужителей, где бы они ни находились – в лагерях, в ссылках, под следствием или на свободе. Все кровавое «мероприятие» было приравнено к военной операции, с привлечением войсковых подразделений.
Арестованных приговаривали по двум категориям: по первой – к расстрелу, по второй – к 10 годам заключения в исправительно-трудовом лагере. Мало кто из архиереев и священнослужителей Русской Православной Церкви пережил этот период. Большинство епархий были разгромлены полностью. Чудом оставшихся в живых священнослужителей оставались единицы.
Более семидесяти лет на месте монастыря царила «мерзость запустения». То, что не уничтожили люди, разрушило время. Казалось, обитель погибла безвозвратно. Но Господь судил иначе. «В смутных обстоятельствах нам не предупредить Господа, хотя бы все приходило в страшную гибель… – писал святитель Иоанн Златоуст еще в 404 году. – Если он творит несущее сущим, нигде и никогда не являющемуся дарует бытие, тем легче Ему поправить то, что есть и что давно было».
Новая жизнь древней обители
Новейшая история Свято-Данилова монастыря связана с празднованием 1000-летия крещения Руси. В 1982 году Святейший Патриарх Московский и всея Руси Пимен обратился в Политбюро с просьбой выделить для устройства официальной резиденции Московской Патриархии один из московских монастырей. Предлагалось на выбор четыре монастыря. Патриарх Пимен, который всегда почитал святого князя Даниила, без колебаний выбрал разрушенный к тому времени монастырь святого Даниила. Однако, несмотря на патриарший выбор, Брежнев незадолго до смерти подписал указ о возвращении Патриархии Донского монастыря. Через неделю после «исторической подписи» Леонид Ильич умер, и церкви отдали Данилов монастырь. Так, по воле Судьбы и Бога, самый первый московский монастырь, основанный первым великим князем Москвы, открывался вновь самым первым в нашем городе.
Храм преподобного Серафима Саровского
Монастырь восстанавливался как «Духовный и Административный Центр РПЦ». Наместником возрождающейся обители был назначен архимандрит Евлогий (Смирнов), основными реставрационными работами руководил архитектор И. И. Маковецкий, участие в работах принимали иконописцы Зинон (Теодор) и Сергей Федоров.
В ходе реставрации были восстановлены все три храма, существовавшие до революции, устроены две новые церкви и две часовни, в здании бывшего Братского больничного корпуса, примыкающего к надвратной церкви, освящен храм прп. Серафима Саровского. Снесенная в 30-х годах до первого яруса колокольня с надвратным храмом прп. Симеона Столпника была выстроена заново.