После падения Аббасидского халифата в Багдаде и империи Хорезмшахов в Ургенче, с течением времени присущий исламу того периода дух свободы творчества, исследований и новаторства, стимулирующий важнейшие для истории всего человечества научные открытия и изобретения, бесследно исчез. Его место заняли догматические учения отдельных ортодоксальных схоластиков монгольского происхождения. Дошло до того, что научные исследования и здоровая критика вовсе были отделены от учебного процесса, что противоречило учению Корана. Стремление к наукам, обогащение своих знаний изначально в исламе считались первостепенной задачей каждого, кто считает себя мусульманином, но, бесспорно, этого можно достичь только в результате упорного поиска новых знаний.
Некоторые реакционные деятели культа стремились, чтобы религиозное учение и религиозная юриспруденция стали основной сферой деятельности мусульманских ученых. Для достижения этой цели они при поддержке властей уже к XIV в. окончательно отменили в учебных заведениях изучение светских наук. В результате в исламском мире постепенно дух догматизма и схоластики одержал победу над свободомыслием и вольнодумством, что также явилось одной из причин заката исламской цивилизации. Ведь власть, которая опирается на насилие, деспотизм и угнетение собственного народа, не может допустить свободы мыслей и действий. «За этим последовала долгая и тягостная интеллектуальная летаргия, следствием чего стал политический и экономический упадок. Запад не замедлил извлечь из этого выгоду для своих эгоистических целей»[3]
. Известно, что IX–X вв. считают начальным этапом развития науки и просвещения Запада. Но здесь процесс развития длился слишком долго, и на протяжении веков западная наука не только была не в силах укрепить свою значимость, а, напротив, наметился регресс. Только в эпоху Возрождения, начиная с XVI в., наблюдается процесс ускоренного и успешного развития. Причем в исламском мире развитие науки, культуры и просвещения берет начало в VIII в. и уже в IX–XI в. достигает своего высочайшего уровня.Странам Запада только после XV–XVI вв. в результате упорных усилий удалось повысить научно-образовательный уровень населения. Именно благодаря невиданному развитию науки и просвещения им удалось занять достойное место в данной сфере. В то же время мусульманские народы подвергались жесточайшему насилию со стороны монгольских варваров, и это была настолько деспотичная тирания, что в дальнейшем, в течение веков, вплоть до XX в., ощущались последствия того кошмара. За это время мусульмане полностью утратили богатейшую цивилизацию. Они лишились сокровищниц науки и знаний, высочайшей степени, на то время, просвещения и культуры. Таким образом, в то время, когда на Западе развивались науки и образование, мусульманский мир оказался в темноте и невежестве.
В начале XVI в. в Европе (Германии) произошла Великая Реформация – образование и просвещение были отделены от церкви и священнослужителей. По мнению известного татарского мыслителя Мусы Бигиева (1883–1943), после этого человеческий разум стал быстро осваивать бескрайние просторы материального мира и открывать всё новые кладовые и тайны природы. Продолжая свои мысли об этом, Бигиев не без эмоций пишет: «Благодаря освобождению разума из угнетающих пут церкви западный мир ступил на путь прогресса. В то время [учащиеся] мусульманских медресе были заняты чтением толкований и комментариев к каламическим [догматическое богословие] книгам. Мусульманские богословы были увлечены написанием [таких] толкований и гордились этим. В то время разум и мысль мусульман были пленниками в руках факихов [мусульманских правотворцев], слепо подражавших установлениям древних авторитетных богословов и возгордившихся мутакаллимов [догматистов]. Видимо, именно из-за влияния застоя, поразившего головы всех мусульман, мир ислама лишился жизни, застыл без движения!»[4]
Начиная с XIV в., после устроенной монголами массовой резни, истребления всех до единого высокообразованных мусульманских священнослужителей и духовных лиц, опустевшей нишей завладели малограмотные и невежественные догматики. Со временем они заняли в мусульманском обществе второе после монгольских чиновников положение. Монгольские захватчики в лице подобных священнослужителей видели верных себе союзников. Вскоре подобные догматики и невежды охватывают все сферы науки, образования и исследований, именно под их влиянием начинается преследование мусульманских свободомыслящих ученых.
Таким образом, в то время, когда Европа все больше отделяла общество от влияния деспотичных инквизиторов и запрещала вмешательство религии в сферы науки и образования, в исламском мире, наоборот, важнейшую для развития общества нишу отдали в подчинение малограмотным ортодоксальным невеждам.