8 января 1892 г. главным инспектором по пересылке арестантов и заведующим этапно-пересыльной частью Главного штаба назначается помощник начальника штаба Московского военного округа генерального штаба генерал-майор Николай Васильевич Левицкий. Воспитанник кадетского корпуса, окончивший Николаевскую военную академию по I разряду, он прошел солидную школу жизни и отличился на военном поприще: служил в артиллерийской бригаде, штабе Киевского военного округа, преподавал тактику в Киевском пехотном училище, участвовал в русско-турецкой войне 1877 – 1878 гг. и за отличия в боях был награжден золотой шпагой с надписью «За храбрость», три года командовал после войны полком, затем работал в Главном комитете по устройству и образованию войск, после чего в 1885 г. произведен в генерал-майоры и назначен начальником штаба Иркутского военного округа, а в марте 1889 г. переведен в Москву помощником начальника штаба МВО.
В записке военного министра генерал-адъютанта П.С. Ванновского, представившего генерал-майора Н.В. Левицкого на новую должность, говорилось:
Естественно, наше представление о нем и его деятельности основывается на тех скудных источниках, которые удалось выявить в архивах. Возможно, в дальнейшем в результате дополнительных изысканий оно расширится.
Под его руководством продолжалось перераспределение сил конвойных команд, сокращение штатной численности или полная ликвидация одних, увеличение ее в других командах, создание новых в пределах общей штатной положенности конвойной стражи, которая оставалась незыблемой. Это делалось по мере роста железнодорожного сообщения в стране, открытия новых навигационных путей по сибирским рекам.
Усиленно вводилось пользование за счет казны телеграфом для оповещения на этапах об отправляемых арестантских партиях. Ряд этапных трактов сокращался или вовсе ликвидировался. Были расформированы местные команды, занимавшиеся сопровождением арестантов на трактах между Ишимом и Тобольском, между Омском и Тарой. В летнее время арестантов из Тобольска переправляли на зафрахтованных пароходах в Тюмень под конвоем Тюменской пароходно-конвойной команды, далее до Ишима конвоирование шло по тракту.
В связи с расширением железнодорожной сети учреждались новые маршруты перевозок арестантов: на Юго-Западной ж.д. от Умани до Казатина, на Самаро-Златоустовской ж.д. от Уфы до Челябинска, а также по Лозово-Севастопольской, Ржево-Вяземской, Ромно-Кременчугской линиям и по узкоколейной дороге, соединяющей Новгород-Северский, Кролевец и Конотоп.