Искусственность подбора представителей в Сибирской Областной Думе вооружила против нее значительную часть интеллигенции, особенно из партии «народной свободы». Вызывала сомнения и самая идея сибирской автономии, которая казалась проявлением сепаратизма. Вооружились против Думы и большевики.
«Сибирская Речь» назвала Сибирскую Областную Думу «новой социалистической затеей». Другие влиятельные газеты, как, например, газета Дальнего Востока «Голос Приамурья», сторонница еще большей децентрализации, назвала фантастической идею объединения всей Сибири и Степного края в одно целое, связывающего в одном централистическом учреждении, Сибирской Областной Думе, чуть ли не шестую часть земной суши.
Советы, поддерживаемые Москвой и Петроградом, по отношению к Сибирской Думе заняли непримиримую позицию. Ачинский совет рабочих и солдатских депутатов, соглашаясь с Красноярским Исполнительным Комитетом, «попытку контр-революции, под видом автономии Сибири и созыва Сибирского Учредительного Собрания, признает недопустимой» и просит Томский совдеп принять все меры, начиная с разгона и ареста, не останавливаясь перед использованием вооруженной силы, «для того, чтобы отстоять власть советов».
В состав Временного Областного Совета вошли Потанин, ушедший в конце декабря, Дербер, Патушинский, Шатилов, Новоселов и Захаров.
Областному Совету была поставлена съездом очень узкая и ограниченная задача: созвать к 10 января [1918 г.] Областную Думу, на основаниях, выработанных съездом.
Только к 20 января собралось около ста человек, и на 1 февраля назначено было открытие Думы. До тех же пор происходили совещания фракций Думы и частные совещания членов Думы. Наиболее сильные группировки Думы были: фракция социалистов-революционеров и фракция представителей различных народностей Сибири (называлась она «фракцией национальностей»). Эта фракция была настроена умереннее, чем эсеровская. В составе ее, кроме туземцев: киргиз, бурят, якутов, были поляки, украинцы и немцы-колонисты.
Главное внимание во фракциях было сосредоточено на вопросах о пополнении состава Областной Думы представителями «цензовых» элементов и о выработке избирательного закона в Сибирское Учредительное Собрание, которое, по мысли декабрьского чрезвычайного съезда, должно было быть созвано в марте 1918 г. Временное Правительство, которое предположено было избрать в Думе, должно было, в сущности, заняться только проведением выборов в Сибирское Учредительное Собрание.
В то время как Областной Совет и Сибирская Дума стремились собрать Сибирь и начать совместно с другими частями России борьбу с большевиками, большевизм начал уже укрепляться в Сибири не как политическая партия, а как власть. В середине декабря [1917 г.] Омск перешел в руки большевиков. Но партия эсеров ожидала, что Всероссийское Учредительное Собрание одолеет большевизм, и что, в случае посягательства на Учредительное Собрание, по всей России вспыхнет гражданская война с большевиками. В январе большевики стали распространять свое влияние на Томск, не решаясь, однако, выступать решительно против Областного Совета и Думы. В ночь с 25 на 26 января большевики, желая, очевидно, предупредить открытие Думы, неожиданно для Областного Совета, арестовали членов его: Патушинского, Шатилова и нескольких членов Думы, в том числе Якушева, намеченного фракциями в председатели. Из остальных членов Областного Совета в Томске находился Дербер, которому удалось избежать ареста. Дербер и представители фракций, собираясь конспиративно, решили устроить тайно от большевиков заседание Областной Думы, на котором было избрано Временное Сибирское Правительство.
На частной квартире собравшаяся исподтишка небольшая группа членов Думы, человек около двадцати из полутораста, «избрала» шестнадцать министров с портфелями и четырех без портфелей. Шесть человек присутствовавших самоизбрали себя в совет министров.
Постоянно прислушиваясь, не идут ли большевики, храбрые заговорщики быстро выкрикивали имена кандидатов, едва успевая остановиться на их оценке, избирая даже случайных незнакомых лиц, каким был, например, И. Михайлов, предложенный в министры финансов одним случайным участником из состава «аппарата». Никто не задумывался и над тем, согласны ли избираемые, будут ли они довольны «компанией» Дербера и др. Так попали в министры не запрошенные никем об их согласии Вологодский, Устругов, Серебренников, Крутовский.
Процедуры избрания никакой не было. Применена была система «par acclamation».-
В результате, Дума избрала:
Председателем — Дербера, министрами: Вологодского, Крутовского, Краковецкого, Новоселова, Ив. Михайлова, Серебренникова, Патушинского, Ринчино, Колобова, Устругова, Юдина, Тибер-Петрова, Сулима, Жернакова, Моравского, Шатилова, Кудрявцева, Захарова, Неометуллова. Председателем Думы был избран Якушев.