Целью Габсбургов, опиравшихся на католическую церковь всецело, от начала до конца, была в тот период рекатолизация всех подвластных им земель. Как и повсюду, в Чехии надежными помощниками контрреформации стали иезуиты. Эти члены ордена, основанного отставным испанским офицером Игнатием Лойолой, начинали очень незаметно. Они учредил в Праге колледж -- Клементинум (ныне здесь находится университетская библиотека), и их школа получила хорошую репутацию. Подтверждается это и тем, что сюда стали посылать детей и некатолики. Однако со временем иезуиты печально прославились тем, что они насильно заставляли некатоликов принять "истинную веру".
Вот в такое время и в такой атмосфере двадцатичетырехлетний Рудольф вступает на чешский престол. В Праге во время торжественных похорон его отца Максимилиана происходит довольно комический эпизод: удар древка одного из знамен о Староместскую мостовую вызывает такую панику, что вся похоронная процессия, императорские и чешские сановники, духовенство и дворянство разбегаются и прячутся по соседним дворам. Молодой Рудольф, всеми покинутый, остается в одиночестве и страхе у гроба своего отца. Не правда ли, странное знамение в самом начале правления?
Вначале Рудольф нерешительно кочует между Прагой и Веной (традиционной резиденцией Габсбургов). В 1583 году он окончательно останавливает свой выбор на Праге, где и проводит почти тридцать лет, которые мы называем сегодня рудольфовским периодом. Чешский сейм охотно выделяет средства для ремонта Града, который вскоре начинает сиять первозданной красотой. И Рудольф правит отсюда чешским и венгерским королевством и римской империей.
По свидетельствам современников, Рудольф произвел в Праге хорошее впечатление. Его описывают как симпатичного мужчину среднего роста, с ухоженным лицом, приятного в обращении. Особенно подчеркивают его приветливость.
Англичанин Эванс, написавший современную монографию о Рудольфе II, утверждает, что мир знает трех Рудольфов. Первого слабого правителя, который начал править по старой славной традиции, но после неудач в своей внутренней и внешней политике оказался пленником в собственном Граде. Второго -щедрого мецената, покровителя наук и искусств, художников Арцимбалда и Спренжера, ученых Кеплера и Тихо де Браге. Художественные сокровища, собранные в Пражском Граде, не имели себе равных в тот период, когда коллекционирование было модой и страстью всех, кто мог себе это позволить. (Здесь необходимо сделать замечание о том, каким на самом деле было "щедрое меценатство" Рудольфа -- в частности, в отношении де Браге и Кеплера. Первому он пообещал 3000 дукатов в год, второму -- 1 500 дукатов, что в то время означало действительно большую щедрость. Но пообещав, Рудольф уже не взял на себя труда проследить, получают ли оба астронома положенное жалованье. А они его не получали). И, наконец, третий Рудольф, как утверждает Эванс, был иным, менее приятным. Таинственный, весь во власти оккультных наук, одурачиваемый мошенниками, проходимцами, такими, как например, Келлей, занимавшийся каббалистикой, герметизмом и многими другими суевериями. Его навязчивые идеи граничили с помешательством.
Каким был Рудольф II в действительности!
Скорее всего, он представлял собой комбинацию всех трех приведенных Рудольфов.
Период его правления далеко не был безмятежно-счастливым. Он характеризуется прежде всего углубляющимися разногласиями между католиками и некатоликами. Появляется новое поколение католиков, воспитанных уже в иезуитских школах, как, например, Зденек Войтех Попел из Лобковиц, Вильям Славата, Ярослав Боржита из Мартиниц. Но здесь же существует и новое поколение некатоликов, возглавляемое в Чехии Вацлавом Будовцем из Будова, а в Моравии Карелом - старшим из Жеротина Равновесие между ними нарушается в 1599 году, когда, по наущению испанского посла и папского нунция, Рудольф II выдворил протестантских чешских земских сановников и заменил их католиками. Зденек Войтех Попел из Лобковиц стал верховным канцлером и начал проводить последовательную рекатолизацию и централистскую политику. Его мечтой была великая центрально-европейская абсолютная монархия, в сердце которой было бы чешское королевство.