За пять дней до начала боевых действий обе авиагруппы начинали скрытую морскую воздушную разведку. При ее проведении запрещалось без специального приказа нарушать государственную границу и пролетать над боевыми кораблями. Радио использовалось ограниченно. Фотографирование проводилось: «а) гавани Кронштадта и Ленинграда, б) Невы (целевые участки), в) рейдов Ревеля и Ханко, г) мест стоянок Палдиски, Лужской и Копорской бухт». В случае обнаружения того, что подлет к объекту замечен противником, выполнение задачи немедленно прекращалось. Помощь и обмен данными фоторазведки авиакомандование «Oslsee» осуществляло с 2-й эскадрильей разведывательной авиагруппы главнокомандующего люфтваффе, под командованием оберстлейтенанта Теодора Ровеля.
За два дня до нападения воздушная разведка велась неограниченно. В ночь перед началом войны проводилось минирование с самолетов. Основные усилия сосредотачивались на минировании в районе Ленинграда и Кронштадта. При возможности вылетов из Финляндии, планировалось запереть Беломорский канал путем уничтожения дамб фугасными бомбами. В дальнейшем планировалось небольшими силами провести минирование мест стоянок в Таллине, Палдиски, Лужской и Копорской бухтах. При появлении советского флота в открытом море, все задачи по минированию становились бы второстепенными. В этом случае, для усиления, авиакомандованию должны были придаваться 2-я авиагруппа 1-й бомбардировочной эскадры. Дляпроведения минирования выделялись 2-я и 3 — я эскадрилья 125-й авиагруппы. Они же осуществляли противолодочную оборону.
Все эскадрильи осуществляли вооруженную разведку. Атака гидросамолетами в рамках вооруженной разведки была разрешена только против подлодок (глубинными бомбами или фугасными бомбами — SC.50). Бомбардировщики Ju.88 разрешалось примененять против одиночных военных кораблей. В случае успешного наступления сухопутных войск, необходимо было быть в готовности совершить перебазирование: «Для 806 [авиагруппы] — Либава, Вайноден, Аренсбург. Для 125 [авиагруппы]: Либава, Виндава, Аренсбург». Для ведения разведки и противолодочной обороны в Финском заливе, в готовности к перебазированию в Финляндию должна была находиться 2-я эскадрилья 125-й авиагруппы с самолетами Не.114. Вкачестве подвижного наземного пункта авиагруппа могла использовать корабль обеспечения полетов «Karl Meyer», находящийся в Пиллау. Для выполнения задач по ремонту и снабжению в интересах авиакомандования можно было задействовать находящееся в Киле судно «Bukarest» морского авиационного отдела.[117]
В директиве фюрера № 21[118]
, утвердившей 18 декабря 1940 года план «Barbarossa», задачи кригсмарине были определены следующим образом: «В войне против Советской России кригсмарине предстоит задача, обеспечивая оборону своего побережья, воспрепятствовать прорыву военно-морского флота противника из Балтийского моря. Учитывая, что после выхода к Ленинграду русский Балтийский флот потеряет свой последний опорный пункт и окажется в безнадежном положении, следует избегать до этого момента крупных операций на море. После нейтрализации русского флота будет необходимо обеспечить полную свободу морских сообщений в Балтийском море, в частности, снабжение по морю северного фланга сухопутных войск (траление мин!)».Командованием кригсмарине планирование и ведение боевых действий против СССР в Арктике и на Балтике было поручено военно-морской группе «Noid» (штаб в Киле), командующий генерал-адмирал Рольф Карльс. В подчинении этого командования на Балтийском море было военно-морское командование «Oslsee» (штаб в Киле), командующий адмирал Гюнтер Гузе.
Командиру ВМС «Oslsee» подчинялись: командующий силами охранения на Балтике, военно-морской командующий в Дании, а также командующие береговой обороной Западной Балтики, Померании и Восточной Балтики. Вапреле 1941 года перед нападением на СССР была введена должность военно-морского командующего «С», зона ответственности которого была от Лиепаи до Риги. На эту должность был назначен контр-адмирал Франц Клаассен. В мае 1941 года была введена должность военно-морского командующего «D», с зоной ответственности от Риги до Таллина.[119]
Непосредственно корабельной группировкой в Балтийском море руководил штаб Командующего крейсерами (BdK), командир — адмирал Губерт Шмунд. Ему оперативно подчинялись: Начальник над тральными соединениями «Noid» (FdM Nord), командир — капитан цур зее К. Бёмер. Эта группировка действовала в открытом море. Корабельной группировкой в Финском заливе руководил штаб Начальника миноносцев (FdT), командир — контр-адмирал Г. Бютов.[120]
Подводные лодки подчинялись Командующему подлодками.