Наибольшее значение, с оперативной точки зрения, Лиепая имела как самый западный и незамерзающий порт на Балтике. В то же время географическое положение военно-морской базы имело ряд существенных недостатков. Со стороны моря не было островных укреплений. Рейд и внешняя гавань были практически открыты для наблюдения с моря и воздуха.[13]
Однако других незамерзающих портов, кроме Вентспилса, у КБФ не было.[14] Последний имел те же недостатки, еще меньшую вместимость и слабую судоремонтную инфраструктуру.После начала реализации советско-латвийского договора, Военный совет КБФ 8 октября 1939 года принял решение иметь в Лиепае крупную группировку кораблей. 22 октября в Лиепаю пришли крейсер «Киров», эсминцы «Сметливый» и «Стремительный». 24 октября туда же прибыл эсминец «Стерегущий». В октябре в Лиепае был развернут пост СНиС.
Управление Либавской военно-морской базы (ЛибВМБ) было сформировано с 21 октября 1939 года. Командиру и военкому подчинялись все части, базировавшиеся в Лиепае и Вентспилсе. Район ответственности базы был установлен от Лиепаи и далее на север до Михайловского маяка включительно. Первым командиром базы стал капитан 1 ранга Мергин. Согласно порядку старшинства, установленного приказом командующего КБФ № 0407 от 16 августа 1940 года, командир ЛибВМБ был вторым по очереди после командира эскадры, командир ОЛС (отряд легких сил) был третьим.[15]
До 4 февраля 1940 года командование ЛибВМБ подчинялось заместителю командующего КБФ в Таллине, а затем Военному Совету КБФ. Командиру базы во всех отношениях подчинялись:— артиллерийские дивизионы и батареи береговой обороны (БО),
— инженерные, саперные, железнодорожные и стрелковые части,
— части связи, — авиазенитные средства,
— охрана рейдов базы,
— тыловые органы (склады, мастерские, санитарно-лечебные),
— политико-просветительские учреждения (дом ВМФ, клубы).
В оперативном отношении командиру базы подчинялись районы и участки СНиС, временно базирующиеся на базу корабли. Для усиления обороны базы ее командиру по решению Военного совета КБФ могли придаваться соединения торпедных катеров и подводных лодок.
Народным комиссаром ВМФ 11 ноября 1939 г. было утверждено «Временное положение о командире военно-морской базы в Лиепае»[16]
. Согласно положения, на командира базы были возложены следующие задачи:— оборона района базы и подступов к ней от морского и сухопутного противника,
— противовоздушная оборона базы,
— охрана рейдов и гавани базы,
— материально-техническое обеспечение и ремонт базирующихся кораблей и средств береговой обороны,
— обеспечение постоянной боевой готовности базирующихся частей и кораблей,
— руководство мобилизационной работой частей и учреждений и составление общего мобилизационного плана базы,
— расквартирование береговых частей и учреждений в пределах базы, разработка диспозиции стоянок кораблей в базе,
— организация повседневной, дежурной и караульной службы в базе,
— обеспечение пожарной безопасности базы,
— организация санитарно-профилактического и лечебно-эвакуационного обеспечения базы.