Важным аспектом правовой базы, регулирующей правосудие переходного периода, является режим вынесения приговора, установленный Законом «Об амнистии». В соответствии с этим Законом лица, совершившие тяжкие преступления, будут отбывать наказание от пяти до восьми лет «эффективного ограничения свободы и права», если они признают ответственность за свои преступления и предоставляют гарантии неповторения в начале разбирательства дела. Те, кто позже будут подвергнуты ответственности за совершенные преступления, будут содержаться в течение того же срока в обычных условиях тюрьмы, в то время как тем, кто не признается в совершении преступлений в случае установления их вины, могут быть назначены тюремные сроки до двадцати лет.
П. 3.2 Соглашения о мире, заключенного в 2016 г., указывает, что лица, совершившие преступления против человечности, геноцид, тяжкие военные преступления, захват заложников или другое серьезное лишение свободы, например, похищение мирных жителей, пытки, внесудебные казни, исчезновения, насильственные половые акты и другие формы сексуального насилия, насильственные перемещения, принудительный труд и вербовку несовершеннолетних не будут подлежать амнистии или помилованию (либо эквивалентным льготам). Хотя первоначальный текст Закона об амнистии исключал амнистию, помилование и отказ от уголовного преследования за тяжкие военные преступления, которые были определены как нарушения международного гуманитарного права, совершенные систематически, Конституционный суд установил, что эти льготы не могут быть предоставлены лицам в случае совершения любых военных преступлений, независимо от того, были ли они совершены систематически или нет. Конституционный суд указал, что систематичность не является обязательным элементом поведения, соответствующего понятию военного преступления по международному уголовному праву.
Согласно ст. 8 Закона «Об амнистии»62
амнистия или помилование могут быть предоставлены только за политические и связанные с ними преступления. Закон 1820 от 2016 г. содержит понятие политического преступления: «Политическими преступлениями будут считаться преступления, в которых пассивным субъектом противоправных действий является государство и его действующий конституционный режим, если они совершаются без личной выгоды. Амнистии также подлежат преступления, связанные с политическими преступлениями, включающие поведение, непосредственно связанное с развитием мятежа и совершенное в период вооруженного конфликта, а также деяния, направленные на содействие, поддержку, финансирование или сокрытие развития мятежа»63.С июня 2004 г. ситуация в Колумбии являлась объектом предварительного расследования Международного уголовного суда. Бюро Прокурора Международного уголовного суда отмечало готовность властей Колумбии расследовать и привлекать к ответственности лиц, совершивших военные преступления и преступления против человечности. Механизм JEP получил поддержку в Международном уголовном суде: «Мы согласились с тем, что меры правосудия переходного периода, которые Колумбия решила принять, могут, при условии надлежащего осуществления, отвечать целям подотчетности, наличия ресурсов для жертв и вклада в сдерживание будущих преступлений, предусмотренных в Римском Статуте. Поэтому мы поддержали JEP как ключевой механизм правосудия переходного периода, принятый в соответствии с мирным соглашением. Мы также отметили некоторые опасения, недавно высказанные Генеральным прокурором страны, например, в отношении важности привлечения прямых исполнителей к ответственности. В этом смысле мы хотим, чтобы Генеральная прокуратура и JEP могли совместно наладить эффективное распределение работы и взаимодействие. С этой целью мы отмечаем важность того, чтобы JEP имел определенную правовую базу». В конце 2021 г. МУС прекратил предварительное расследование ситуации в Колумбии, исходя из того, что колумбийское правосудие самостоятельно справляется с задачей привлечения к ответственности лиц, совершивших военные преступления и преступления против человечности: «28 октября 2021 г. на основе тщательного юридического и фактологического анализа имеющейся информации Управление пришло к выводу об отсутствии разумных оснований полагать, что потенциальные дела, возникающие в результате расследования ситуации, будут приемлемыми. Это произошло потому, что, основываясь на оценке фактов в том виде, в каком они существуют в настоящее время, национальные власти Колумбии нельзя охарактеризовать как бездействующие, нежелающие или неспособные реально расследовать и преследовать в судебном порядке соответствующие преступления, предусмотренные Римским статутом. Соответственно, прокурор решил закрыть предварительное расследование с учетом возможного пересмотра при существенном изменении обстоятельств»64
.