Однако были и другие мнения. По словам придворного поэта Лоренцо Медичи Луиджи Пульчи, Зоя напоминала раскрашенную куклу. «На груди у нее были две огромные турецкие жемчужины, подбородок двойной, щеки толстые, все лицо блестело от жира, глаза распахнуты, как плошки, а вокруг глаз такие гряды жира и мяса, словно высокие дамбы на По. Ноги тоже далеко не худенькие, таковы же и все прочие части тела – я никогда не видел такой смешной и отвратительной особы, как эта ярмарочная шутиха… С тех пор мне каждую ночь снятся горы масла, жира, сала, тряпок и прочая подобная гадость».
Рассудил этот нешуточный спор антрополог С. А. Никитин, который воссоздал великолепный скульптурный портрет великой княгини. Перед нами предстает женщина выдающегося ума и сильной воли, с решительным и сильным характером. В ходе исследования выяснились любопытные подробности, которых нет в письменных источниках. Теперь известно, что Софья была небольшого роста – не более 160 см, имела небольшие усики, болела остеохондрозом и имела серьезные гормональные нарушения, обусловившие мужеподобность облика и поведения.
С появлением Софьи Палеолог в Москве изменились понятия о государевом дворце и придворные обычаи. В них стало больше показного помпезного благолепия. Появились придворные чины, а пышный дворцовый этикет стал напоминать византийский. Великая княгиня «завела» собственную «Думу» из членов свиты, устраивала «дипломатические приемы» на своей половине, принимала иностранных послов и вела с ними учтивую беседу. Кстати, именно Софья ради женитьбы своего сына Василия ввела византийский обычай – смотр невест.
Однако именно за перемены в тихой московской жизни москвичи и невзлюбили византийскую принцессу. По словам современников, гордая княгиня не пользовалась популярностью в народе, ее считали умной, но спесивой, хитрой и коварной. Особенно строг к Софии был ее пасынок, Иван Молодой, сын Ивана III от первого брака с Марией Борисовной Тверской, умершей совсем молодой, не достигнув тридцатилетнего возраста.